| 查看: 6014 | 回复: 16 | ||
chenfeng0312铜虫 (初入文坛)
|
[求助]
如何使用blast进行多序列两两比对
|
|
|
比如，我有四个核酸序列a b c d。现在需要两两比较他们的相似度。得出相似度的集合为：ab ac ad bc bd cd. blast有没有这样的功能可以一次性做这些工作。 如果手工两两输入比较根本就做不完太多了。 我意思是，不管是网络版还是单机版，能不能直接输入a b c d，然后就得到所有两两比较的结果？ |
回复此楼» 猜你喜欢
22408调剂315分
已经有3人回复
-
材料考研调剂
已经有26人回复
-
化工调剂求导师收留！一志愿失利，踏实肯干，有植物提取科研经历
已经有21人回复
-
290求调剂
已经有4人回复
-
药学305求调剂
已经有8人回复
-
复试调剂
已经有6人回复
-
0831一轮调剂失败求助
已经有6人回复
-
求助调剂，跨调
已经有11人回复
-
291求调剂
已经有7人回复
-
272分材料子求调剂
已经有45人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样在ncbi blast的比对结果上找到最相似的序列呢
已经有7人回复
- NCBI blast 序列比对遇到的问题
已经有4人回复
- 大家做完本地blast之后序列是如何提取的？
已经有5人回复
- 请问：NCBI Blast里得出的序列的 e value是什么意思？
已经有7人回复
- 想要设计引物 可是NCBI中blast后只有蛋白序列 如何得到基因序列 谢谢啊
已经有15人回复
- 用一对引物blast多条序列
已经有5人回复
- 如何对已经进行BLAST比对的序列进行功能预测
已经有4人回复
- PSI-BLAST怎样输出蛋白序列的PSSM打分矩阵
已经有13人回复
- 求助序列分析BLAST最简洁的教程
已经有19人回复
- 测序结果的疑问
已经有7人回复
- blast中序列种属问题
已经有4人回复
- 同源性与进化树的矛盾
已经有24人回复
- 【求助/交流】如何用NCBI的BLAST来找到一个基因的保守序列?
已经有11人回复
- 【求助/交流】PCR产物序列blast怎么用？
已经有3人回复
- 【求助/交流】用blast做primer和基因序列的检测
已经有3人回复
- 【分享】荧光定量PCR实验指南（一）
已经有20人回复
- 【推荐】序列对齐分析
已经有14人回复
dulei
木虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 1426.9
- 散金: 1257
- 红花: 2
- 帖子: 209
- 在线: 74.5小时
- 虫号: 593568
- 注册: 2008-09-05
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 应助指数-1, 谢谢参与，不过看了那个工具的简介，好像不是楼主所要的功能，还是单一序列对多序列，请详细说明 2013-04-06 08:31:19
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 应助指数-1, 谢谢参与，不过看了那个工具的简介，好像不是楼主所要的功能，还是单一序列对多序列，请详细说明 2013-04-06 08:31:19
|
EBI的Clustal Omega可以实现。 网址：http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/ 输入fasta格式的序列名称和碱基序列。 |
4楼2013-04-05 19:48:34
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
3楼2013-04-05 05:34:11
chenfeng0312
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 751
- 红花: 1
- 帖子: 42
- 在线: 27.1小时
- 虫号: 1567297
- 注册: 2012-01-07
- 性别: GG
- 专业: 计算机科学的基础理论
多谢帮助 6楼2013-04-06 10:32:34
wpwupingwp
木虫 (正式写手)
- 应助: 98 (初中生)
- 金币: 3109.8
- 散金: 250
- 红花: 5
- 帖子: 464
- 在线: 125.6小时
- 虫号: 2026298
- 注册: 2012-09-24
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
10楼2013-04-07 21:37:09
gaoyang636
木虫 (著名写手)
- BioEPI: 17
- 应助: 202 (大学生)
- 金币: 4111.4
- 散金: 7
- 红花: 14
- 帖子: 1108
- 在线: 159.8小时
- 虫号: 384065
- 注册: 2007-05-27
- 专业: 基因组学
2楼2013-04-04 20:56:14
chenfeng0312
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 751
- 红花: 1
- 帖子: 42
- 在线: 27.1小时
- 虫号: 1567297
- 注册: 2012-01-07
- 性别: GG
- 专业: 计算机科学的基础理论
5楼2013-04-06 10:21:27
chenfeng0312
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 751
- 红花: 1
- 帖子: 42
- 在线: 27.1小时
- 虫号: 1567297
- 注册: 2012-01-07
- 性别: GG
- 专业: 计算机科学的基础理论
7楼2013-04-06 10:33:42
8楼2013-04-06 15:59:48
chenfeng0312
铜虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 751
- 红花: 1
- 帖子: 42
- 在线: 27.1小时
- 虫号: 1567297
- 注册: 2012-01-07
- 性别: GG
- 专业: 计算机科学的基础理论
9楼2013-04-07 10:40:27
