[交流] 求助序列分析BLAST最简洁的教程

» 抢金币啦！回帖就可以得到:
查看全部散金贴

1楼2011-11-07 21:57:42

niyq

木虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 1758.8
帖子: 298
在线: 151.8小时
虫号: 61248

我有，咋给你

2楼2011-11-08 01:06:58

niyq

木虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 1758.8
帖子: 298
在线: 151.8小时
虫号: 61248

★ ★ ★
77638333(金币+10): 看了，没有下载，因为我从百度文库里下载过了。 2011-11-08 06:54:29
wanhscn(金币+3): 鼓励应助！热心！ 2011-11-08 08:33:41

引用回帖:

2楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:06:58:
我有，咋给你

下载

3楼2011-11-08 01:09:36

mingzhu392

木虫 (著名写手)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 6809.4
帖子: 1330
在线: 2622.5小时
虫号: 1082505

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

3楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:09:36:
下载

谢谢您的分享！顺便提个问题。就是blast比对后的应该怎么做。用那些比对结果进行系统树的构建，是95%以上的吗？还有比对结果怎么导出，建树！谢谢了！

4楼2011-11-08 09:22:24

zhiruo1029

木虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 3910.9
帖子: 284
在线: 116.8小时
虫号: 306186

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

非常感谢您的分享

5楼2011-11-08 10:55:32

lxf64210785

铜虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 180.7
帖子: 77
在线: 72.8小时
虫号: 1383564

谢谢

6楼2011-11-08 12:08:57

niyq

木虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 1758.8
帖子: 298
在线: 151.8小时
虫号: 61248

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

建树首先选取与自己序列最相似的可能属于同种或者最近缘的序列若干，可能有99、98%的，可以多选几个，然后依次选取同属的其它中的典型菌株的序列、最好是模式菌株的，不要选那些模糊的、可能发表的人也不能肯定的序列，相似性依次可能是97、96、96、94的，走后也可选取较远的序列，最远的一个可以做外群

7楼2011-11-09 00:21:25

Jeanny_GY

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2971.6
帖子: 149
在线: 43.2小时
虫号: 988090

学习了

8楼2011-11-09 06:20:13

fangni

新虫 (正式写手)

应助: 6 (幼儿园)
金币: 2552.2
帖子: 655
在线: 64.1小时
虫号: 723927

谢谢，学习学习

9楼2011-11-09 11:10:31

vaivaiann

铜虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 126
帖子: 76
在线: 21.7小时
虫号: 1305162

谢谢了

12楼2011-11-26 15:02:36

sjm201314

银虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 722.5
帖子: 2
在线: 6.4小时
虫号: 962189

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

比对之后，一个菌株相似性高的很多，比如100%的很多，你怎么看哪个是模式菌株？

赞一下

14楼2012-03-21 10:20:47

summerinsect

木虫 (著名写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 15530.9
帖子: 1115
在线: 169.3小时
虫号: 995500

感谢楼主分享！

15楼2012-04-28 17:18:27

无踪无影

金虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 1822.9
帖子: 82
在线: 60.7小时
虫号: 1406814

谢谢了啊

16楼2012-06-24 16:35:42

swshn

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 485.6
帖子: 152
在线: 13.9小时
虫号: 420888

送鲜花一朵

O(∩_∩)O谢谢

17楼2012-06-25 11:20:14

cooper900916

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 3926.5
帖子: 58
在线: 141.6小时
虫号: 2117148

引用回帖:

3609918楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:09:36
下载

谢谢

18楼2012-12-01 14:07:05

木含24

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 3397.5
帖子: 162
在线: 135.2小时
虫号: 1408619

谢谢，有用

19楼2013-12-17 12:32:05

Libra-z

银虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 415.3
帖子: 120
在线: 141小时
虫号: 3545164

太棒了

20楼2015-10-19 19:34:47