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[交流] 求助序列分析BLAST最简洁的教程

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swshn

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1楼 2011-11-07 21:57:42

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niyq

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我有，咋给你

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2楼2011-11-08 01:06:58

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niyq

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2楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:06:58:
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3楼2011-11-08 01:09:36

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mingzhu392

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3楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:09:36:
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谢谢您的分享！顺便提个问题。就是blast比对后的应该怎么做。用那些比对结果进行系统树的构建，是95%以上的吗？还有比对结果怎么导出，建树！谢谢了！

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4楼2011-11-08 09:22:24

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zhiruo1029

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5楼2011-11-08 10:55:32

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lxf64210785

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лл

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6楼2011-11-08 12:08:57

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niyq

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建树首先选取与自己序列最相似的可能属于同种或者最近缘的序列若干，可能有99、98%的，可以多选几个，然后依次选取同属的其它中的典型菌株的序列、最好是模式菌株的，不要选那些模糊的、可能发表的人也不能肯定的序列，相似性依次可能是97、96、96、94的，走后也可选取较远的序列，最远的一个可以做外群

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7楼2011-11-09 00:21:25

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Jeanny_GY

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学习了

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8楼2011-11-09 06:20:13

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fangni

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谢谢，学习学习

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9楼2011-11-09 11:10:31

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vaivaiann

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谢谢了

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12楼2011-11-26 15:02:36

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sjm201314

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比对之后，一个菌株相似性高的很多，比如100%的很多，你怎么看哪个是模式菌株？

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14楼2012-03-21 10:20:47

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summerinsect

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感谢楼主分享！

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15楼2012-04-28 17:18:27

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无踪无影

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谢谢了啊

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16楼2012-06-24 16:35:42

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swshn

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送鲜花一朵

O(∩_∩)O谢谢

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17楼2012-06-25 11:20:14

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cooper900916

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3609918楼: Originally posted by niyq at 2011-11-08 01:09:36
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谢谢

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18楼2012-12-01 14:07:05

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木含24

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谢谢，有用

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19楼2013-12-17 12:32:05

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Libra-z

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太棒了

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20楼2015-10-19 19:34:47

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爱上大眼睛10楼

2011-11-09 11:14 回复

谢谢分享！

mahoumeimei11楼

2011-11-09 13:10 回复

谢谢分享！

smisuccess13楼

2011-12-03 16:09 回复

谢谢分享！

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