| 查看: 1761 | 回复: 11 | ||||||
kiruwa专家顾问 (职业作家)
|
[求助]
在blast里,如何与最相近的cultured菌株16S rRNA基因信息比对
|
|||||
| 大家一定碰到过这种情况, 有时候想要和cultured 16S rRNA进行比对,可是系统给出的都是uncultured clones,请问如何在blast里设置,能与序列相似度较大的cultured 细菌基因进行比对. 谢谢. |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 有用 | 微生物多样性 |
» 猜你喜欢
基金申报
已经有5人回复
-
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？
已经有7人回复
-
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？
已经有17人回复
-
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
-
疑惑？
已经有5人回复
-
计算机、0854电子信息（085401-058412）调剂
已经有5人回复
-
Materials Today Chemistry审稿周期
已经有5人回复
-
溴的反应液脱色
已经有7人回复
-
推荐一本书
已经有12人回复
-
常年博士招收(双一流，工科)
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
2楼2013-11-25 10:30:22
pph0259
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1037.7
- 散金: 1250
- 红花: 1
- 帖子: 714
- 在线: 120小时
- 虫号: 499511
- 注册: 2008-02-11
- 专业: 微生物生理与生物化学
10楼2013-12-04 09:41:59
better2023
金虫 (小有名气)
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 564.2
- 散金: 50
- 红花: 4
- 帖子: 206
- 在线: 128.8小时
- 虫号: 2499357
- 注册: 2013-06-07
- 专业: 肿瘤诊断
【答案】应助回帖
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励应助 2013-11-25 20:45:43
kiruwa: 金币+2 2013-11-30 09:37:10
感谢参与，应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 鼓励应助 2013-11-25 20:45:43
kiruwa: 金币+2 2013-11-30 09:37:10
|
http://rdp.cme.msu.edu/seqmatch/seqmatch_intro.jsp http://www.arb-silva.de/ 你说的这个问题我也遇到了，正在研究这两个网站，一个是数据库，一个是做进化树的 |
3楼2013-11-25 20:02:37
kiruwa
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +209 - MicEPI: 1
- 应助: 418 (硕士)
- 金币: 6489.4
- 散金: 998
- 红花: 47
- 帖子: 3893
- 在线: 2113.4小时
- 虫号: 1568684
- 注册: 2012-01-08
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 海外博后
4楼2013-11-25 21:20:26
pph0259
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1037.7
- 散金: 1250
- 红花: 1
- 帖子: 714
- 在线: 120小时
- 虫号: 499511
- 注册: 2008-02-11
- 专业: 微生物生理与生物化学
5楼2013-12-03 16:08:13
6楼2013-12-03 16:57:45
kiruwa
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +209 - MicEPI: 1
- 应助: 418 (硕士)
- 金币: 6489.4
- 散金: 998
- 红花: 47
- 帖子: 3893
- 在线: 2113.4小时
- 虫号: 1568684
- 注册: 2012-01-08
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 海外博后
7楼2013-12-03 16:59:32
pph0259
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1037.7
- 散金: 1250
- 红花: 1
- 帖子: 714
- 在线: 120小时
- 虫号: 499511
- 注册: 2008-02-11
- 专业: 微生物生理与生物化学
8楼2013-12-04 09:19:05
pph0259
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1037.7
- 散金: 1250
- 红花: 1
- 帖子: 714
- 在线: 120小时
- 虫号: 499511
- 注册: 2008-02-11
- 专业: 微生物生理与生物化学
9楼2013-12-04 09:20:53