24小时热门版块排行榜    

查看: 4753  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zwdnet

铁虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】做培养细胞的RT-PCR,β-actin内参出现两个条带,求原因。

我进行培养细胞的RT-PCR,按试剂盒说明提取总RNA后,用一步法进行RT-PCR,用内参β-actin的引物进行,产物长度315bp,反应条件为:50摄氏度30min,94摄氏度2min,94摄氏度30s,59摄氏度30s,72摄氏度1min(上述三步进行30次),72摄氏度7分钟,然后用产物进行电泳,结果两个样本(是两瓶细胞中分别提取的总RNA)在紫外仪下均看到两个条带(见照片)。请问这是不是正常?
另外我还有个问题请教:做RT-PCR是不是只要像这样条带出来就行了?如果要定量,是不是一个培养瓶里的细胞提出来的RNA只能算一个样本?比如我有两瓶细胞,一个做实验组加药,一个做对照组不加,两瓶细胞分别提取一份总RNA,然后各分成3份同时进行RT-PCR,最后获得6个电泳后的光度值(实验组3个,对照组3个),之后按实验组3个样本,对照组3个样本进行统计学分析。这样是不是可以?还是一定要实验组养3瓶细胞,对照组养3瓶细胞,每瓶提取1份总RNA?
我第一次做RT-PCR,不太懂,谢谢帮助!


/*-------------------------------------以下为2月18日新增的---------------------*/
又做了一次,从提总RNA开始,这次是正式实验,加了干预因素的,还分了时间段(上次只是走一遍整个过程)还是内参有两个条带,这次我是连目的基因一块儿做了,目的基因很好,但是内参还是有两个条带。这次我一共做了18个泳道,截图是其中4个,最左边是Marker,不太清楚,接着两条是目的基因,最右边是β-actin内参,还是有两个条带。我的问题是如果是DNA污染,应该是3个基因都有污染吧?我还有个问题:像这样的图片能定量吗?因为所有时间段的所有基因都有条带,也就是说没有空的,我问了实验室老师,实验室只能出这样的图片,出不了数据的。谢谢了。


[ Last edited by zwdnet on 2011-2-18 at 22:50 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿修罗Axuro

金虫 (小有名气)


zwdnet(金币+1): 对我帮助很大,非常感谢! 2011-02-22 12:21:56

楼主的引物多长?如果在20边上徘徊的话估计是引物太短,特异性不够,可以考虑设计到25左右,而且可以把引物放到NCBI的引物BLAST里去BLAST一下,看是不是可以PCR出其他产物。另外可以增加退火温度,提高特异性。
如果楼主要进行统计学分析,个人认为必须3份分开提RNA,不能一起提了再分开做,不然就相当于是只有一个样本,重复3次而已。楼主要的是3个平行样本。
另外,提醒下楼主,内参的作用是用于消除模板量的差异,但是PCR的循环数和模板达到一定量时,产物的总量会达到一个平台,也就是说,模板加多加少,产物跑胶都会差不多的亮,这样楼主就会认为各体系内加入的模板数量是一样的(其实不可能一样),于是内参来消除模板量差异就无法起作用,要减少循环数,以达到内参之间的亮度有差异。
8楼2011-02-19 09:36:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

rioarsenal

金虫 (正式写手)



amisking(金币+1): 鼓励发帖交流! 2011-01-28 19:44:00
怎么没有marker啊?

这EB加的也太多了,胶都红了。。
2楼2011-01-28 16:28:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zwdnet

铁虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by rioarsenal at 2011-01-28 16:28:38:
怎么没有marker啊?

这EB加的也太多了,胶都红了。。

marker是最左边那个,好像是100bp到400bp的,我是在电泳仪旁边的紫外仪里用自己的数码相机拍的,不是专门的拍电泳图片的设备(当时已经六点多,管拍照的老师下班了),那个紫外仪只是给人观察用的,前面有个小门,平时观察时要关门的,为了拍照只能半开着,偏红不知道是不是这个原因。谢谢。
3楼2011-01-28 23:48:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lstt09nk(金币+1): 鼓励交流 2011-02-18 19:57:45
不是引物特异性不好,就是提取的RNA有DNA污染

marker不清晰,没法怎么判断~~
4楼2011-01-30 09:58:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +7 zjl的号 2026-03-16 12/600 2026-03-17 18:22 by 重科小霸王
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 268求调剂 +6 好运连绵不绝 2026-03-12 7/350 2026-03-17 14:56 by 呦呦忧郁
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 279求调剂 +3 抓着星星的女孩 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:47 by userper
[考研] 0703化学调剂 +4 快乐的香蕉 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:41 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 283求调剂,材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
信息提示
请填处理意见