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cherry5323

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】PCR的若干问题 已有7人参与

PCR的退火温度怎么决定啊?在知道一对引物的各自TM值的情况下,怎么确定退火温度?
扩增1665bp和1445bp的条带,有没什么特殊的要求?
两对引物一起做,一个引物各做8个温度梯度,为什么一个引物都扩出来了,一个引物都没有扩出来?
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)

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dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-11-01 10:14:10
那么短的片段。怎么都能扩出来的。   扩不出来考虑其他因素 比如引物设计 比如样品。   
这样的东西最好重复几次。 别一次没出来就问。 很多偶然因素 你并不知道的。
4楼2010-11-01 09:55:24
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超然渡陈之家

新虫 (初入文坛)

★
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“为什么一个引物都扩出来了,一个引物都没有扩出来”这句话什么意思?
2楼2010-10-30 15:29:11
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aaron2012

银虫 (初入文坛)

★ ★
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dhd997(金币+1):鼓励交流。 2010-11-01 10:14:03
延伸时间你是多少啊   然后你设置的温度梯度是多少啊   一般是给的TM值减去5到10,我建议你试一下55度     我也遇到和你一样的情况   55 就做出来了   另外你看是不是加样的时候出现问题了  多做几次
生物,特别是分子生物,贵在坚持!
3楼2010-11-01 09:50:32
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amilie030312

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-11-01 10:14:18
出和不出影响因素很多,要看退火温度对不对,一般的退火温度是TM值减5左右,如果做梯度都没做出来首先可能是你温度范围选择的不对,其次是否是完全按照说明书去做的,再有模板是否GC含量很高,这些都有影响。
呵呵,最后也可能所有问题都想到了还不出,那就换引物吧,片段1K多不算长
5楼2010-11-01 09:56:25
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