应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 【求助/交流】请教blast结果的解读
71/1返回列表
查看: 1652  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】请教blast结果的解读 已有6人参与

将细菌16S rDNA序列提交到GenBank进行比对，得到的比对结果中，有Max score, total score, Max ident等几项，请问哪项指标代表序列最相似？因为我发现有时候score最大者其max ident却不是最大。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-10-07 19:41:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

怎么都行

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
scelab(金币+3):谢谢交流！:tiger06: 2010-10-07 23:24:30
我记得total score是该条比对结果与query的总符合的比例，例如94%意为query序列中总共有94%的序列与该结果能对应。
Max score是最大的一段能与结果对应的序列占query的比例。

Max ident是query能与该条比对结果对应的序列中出现的最高的一致度。

score大的比对结果不见得Max ident就最大，这很正常。一般两者都高的结果就最接近于真实
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-10-07 23:09:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ran2010

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+3):新虫鼓励交流。 2010-10-19 08:34:13
identity代表完全相同的位点个数
positive代表在BLOSUM62（BLAST默认）得分算法下，得分为正的位点个数（楼主是测dna应该是ident=positive吧？）
score是系统自带的算法，比较复杂。。
MAX score是seed扩展过程中的最大得分，total是最后得分
一般看ident就可以啦
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-19 07:25:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

taigongzaici

新虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
开卷有益，又学到不少东西，感谢发帖和回帖的虫子们
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-10-19 08:00:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
本帖仅楼主可见
赞一下
5楼2010-10-19 08:30:30
已阅   申请BioEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

evebobo

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-10-31 13:52:06
请问这些值应该优先考虑哪个呢?  如果都相同怎么选  那么多值都是一样的 但却不是一个属

另外还有一种情况 total score  query    E值      Max ident
                                  337   96%    2e-89          98%
                                  2316  96%    8e-88          97%
这两种情况应该怎么选呢 ？  有没有高人指点  很迷茫

另外还有提交NCBI获取登录号 具体操作
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-10-31 12:06:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tkfg

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我也有这个困惑。score高的，ident不一定最高。如何取舍？
赞一下 回复此楼
7楼2015-05-24 00:23:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 amq7392 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 什么时候开奖？ +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭