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snowdrops

银虫 (初入文坛)

[求助] Blast鉴定细菌16SrRNA 结果选择问题

我得到细菌的16SrRNA,使用blast进行菌种鉴定,但是发现使用Max score,Total score,Query cover,E value,Max ident 排序,第一排的细菌会得到不同的结果,且差距很大。那最后选择哪一个结果呢?哪一个结果比较可信呢?
谢谢!
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siyianhong

银虫 (小有名气)

不清楚,帮顶。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2013-04-05 08:05:11
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一一8778

铜虫 (小有名气)


myprayer: 金币+1, 鼓励应助,分子生物版块,期待你的精彩。 2013-04-07 13:48:34
Max ident,我一般在ncbi中Genbank上选默认的程序,其需要改到其中一个选择就是那个other
3楼2013-04-05 14:11:09
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snowdrops

银虫 (初入文坛)

有听到说用Max score的,有Total score的,也有Max ident。
我有的细菌用不同的排序结果是不一样的,现在还是不是很确定用哪一种好。
4楼2013-04-05 18:45:11
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kaqisa

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
snowdrops(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-04-27 21:07:25
一般是score和e-value会用在论文里,排序时选的score是哪一类查查文献吧。
爱猫爱科研,勇于做个大笨蛋,不怕批评不怕失败。
5楼2013-04-07 10:54:44
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Leo_xin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对于这个我也困惑,求解。  师兄说都差不多。。。。。
还有太多地方值得改进。
6楼2013-04-07 10:58:39
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