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秋电工

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】16srDNA和16srRNA是两不同概念吗? 已有21人参与

在这爬了几天,想学习点大家做16srRNA序列分析的经验,发现两个名词,16srRNA和16srDNA。我有点蒙了,斗胆问下,这两词是一种方法吗?
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leonn

铁杆木虫 (小有名气)

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司马诸葛(金币+2): 2010-04-08 20:00
现在很多文献上面16S DNA 和16S RNA混用的,其实正规的应该是16S RNA gene,做细菌的鉴定方法有很多种的,主要看你要鉴定的菌G+还是G-的,16S RNA gene序列扩增然后测序比对是比较流行的
8楼2010-04-08 08:45:12
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DNAhelix

银虫 (著名写手)

★ ★ ★
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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:46
16S rDNA是基因序列,是转录16s rRNA的模板序列。
16S rRNA是原核生物核糖体RNA。
智慧活法:不生气,不计较!
3楼2010-04-07 22:11:21
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秋电工

新虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2010-04-07 21:07:32:
在这爬了几天,想学习点大家做16srRNA序列分析的经验,发现两个名词,16srRNA和16srDNA。我有点蒙了,斗胆问下,这两词是一种方法吗?

那,那,我再斗胆一次,细菌鉴定适用哪种呢?
4楼2010-04-07 22:32:43
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

说具体点

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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:47
引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2010-04-07 22:32:43:

那,那,我再斗胆一次,细菌鉴定适用哪种呢?

你是想看他们的亲缘关系还是别的,要是一般的就直接通过外表做鉴定了,要是细致比较亲缘关系,就看他们ITS了。这个很流行的。
5楼2010-04-07 23:32:19
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

那我就没办法了


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引用回帖:
Originally posted by 段家一凡 at 2010-04-08 01:16:18:

ITS是鉴定真菌的,细菌就是用16s rDNA鉴定。

看看你能理解这个缩写的吗,我有一个同学也在做,不知道做的什么,我帮你问问。再回复你http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1935213,祝好

[ Last edited by wangqk198738 on 2010-4-8 at 07:17 ]
7楼2010-04-08 07:14:22
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nienie2008

金虫 (小有名气)


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我也准备做这个,开始也被这两个名词搞蒙了,后来看了一些文献,根据个人理解,16Sr RNA应该是gene的名称,属于DNA片段
9楼2010-04-08 08:52:20
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woaipi

木虫 (正式写手)

细菌一般适用16srRNA
没有做不到,只有想不到,只要能想到,就一定能做到!
16楼2010-04-10 22:36:12
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普通回帖

jzhe961

木虫 (正式写手)

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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:46
肯定不一样,16S rRNA 是细菌核糖体小亚基rRNA(small subunit of ribosome)。而16S rDNA则是编码前者的基因或DNA.
2楼2010-04-07 21:22:30
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段家一凡

木虫 (正式写手)


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引用回帖:
Originally posted by wangqk198738 at 2010-04-07 23:32:19:

你是想看他们的亲缘关系还是别的,要是一般的就直接通过外表做鉴定了,要是细致比较亲缘关系,就看他们ITS了。这个很流行的。

ITS是鉴定真菌的,细菌就是用16s rDNA鉴定。
6楼2010-04-08 01:16:18
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家


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引用回帖:
Originally posted by wangqk198738 at 2010-04-08 07:14:22:

看看你能理解这个缩写的吗,我有一个同学也在做,不知道做的什么,我帮你问问。再回复你http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1935213,祝好

[ Last edited by wangqk198738 on 2010-4-8 at ...

ITS 内转录间隔区...细菌大部分是木有滴~~~所以LSSSS说这个是用于真菌鉴定的,没错嘛。
10楼2010-04-08 11:27:28
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