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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】16srDNA和16srRNA是两不同概念吗？
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秋电工

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】16srDNA和16srRNA是两不同概念吗？已有21人参与

在这爬了几天，想学习点大家做16srRNA序列分析的经验，发现两个名词，16srRNA和16srDNA。我有点蒙了，斗胆问下，这两词是一种方法吗？
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1楼2010-04-07 21:07:32
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

leonn

铁杆木虫 (小有名气)
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司马诸葛(金币+2): 2010-04-08 20:00
现在很多文献上面16S DNA 和16S RNA混用的，其实正规的应该是16S RNA gene，做细菌的鉴定方法有很多种的，主要看你要鉴定的菌G+还是G-的，16S RNA gene序列扩增然后测序比对是比较流行的
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8楼2010-04-08 08:45:12
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DNAhelix

银虫 (著名写手)
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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:46
16S rDNA是基因序列，是转录16s rRNA的模板序列。
16S rRNA是原核生物核糖体RNA。
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智慧活法：不生气，不计较！
3楼2010-04-07 22:11:21
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秋电工

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2010-04-07 21:07:32:
在这爬了几天，想学习点大家做16srRNA序列分析的经验，发现两个名词，16srRNA和16srDNA。我有点蒙了，斗胆问下，这两词是一种方法吗？

那，那，我再斗胆一次，细菌鉴定适用哪种呢？
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4楼2010-04-07 22:32:43
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

说具体点

★ ★ ★
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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:47
引用回帖:
Originally posted by 秋电工 at 2010-04-07 22:32:43:

那，那，我再斗胆一次，细菌鉴定适用哪种呢？

你是想看他们的亲缘关系还是别的，要是一般的就直接通过外表做鉴定了，要是细致比较亲缘关系，就看他们ITS了。这个很流行的。
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5楼2010-04-07 23:32:19
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wangqk198738

金虫 (正式写手)

那我就没办法了

★
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Originally posted by 段家一凡 at 2010-04-08 01:16:18:

ITS是鉴定真菌的，细菌就是用16s rDNA鉴定。

看看你能理解这个缩写的吗，我有一个同学也在做，不知道做的什么，我帮你问问。再回复你http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1935213，祝好

[ Last edited by wangqk198738 on 2010-4-8 at 07:17 ]
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7楼2010-04-08 07:14:22
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nienie2008

金虫 (小有名气)
★
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我也准备做这个，开始也被这两个名词搞蒙了，后来看了一些文献，根据个人理解，16Sr RNA应该是gene的名称，属于DNA片段
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9楼2010-04-08 08:52:20
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woaipi

木虫 (正式写手)
细菌一般适用16srRNA
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没有做不到，只有想不到，只要能想到，就一定能做到！
16楼2010-04-10 22:36:12
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普通回帖

jzhe961

木虫 (正式写手)
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1949stone(金币+2): 2010-04-07 23:46
肯定不一样，16S rRNA 是细菌核糖体小亚基rRNA（small subunit of ribosome）。而16S rDNA则是编码前者的基因或DNA.
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2楼2010-04-07 21:22:30
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段家一凡

木虫 (正式写手)
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Originally posted by wangqk198738 at 2010-04-07 23:32:19:

你是想看他们的亲缘关系还是别的，要是一般的就直接通过外表做鉴定了，要是细致比较亲缘关系，就看他们ITS了。这个很流行的。

ITS是鉴定真菌的，细菌就是用16s rDNA鉴定。
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6楼2010-04-08 01:16:18
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holyala

木虫 (著名写手)

砖家
★
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Originally posted by wangqk198738 at 2010-04-08 07:14:22:

看看你能理解这个缩写的吗，我有一个同学也在做，不知道做的什么，我帮你问问。再回复你http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1935213，祝好

[ Last edited by wangqk198738 on 2010-4-8 at ...

ITS 内转录间隔区...细菌大部分是木有滴~~~所以LSSSS说这个是用于真菌鉴定的，没错嘛。
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10楼2010-04-08 11:27:28
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