这种带箭头的基因图怎么做的?
请教,这种带箭头的基因图是如何画出来的?用PPT?还是有专门的软件一键出图?上面的箭头长短我知道应该是基因片段的长度,但是方向如何确定?有的向左有的向右,整个序列其实是一条基因,上面有很多别的基因片段,就是不知道这个方向是如何确定的,希望能遇见大神指点迷津。感谢

1.png@wizardfan@biostar2009
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请教,这种带箭头的基因图是如何画出来的?用PPT?还是有专门的软件一键出图?上面的箭头长短我知道应该是基因片段的长度,但是方向如何确定?有的向左有的向右,整个序列其实是一条基因,上面有很多别的基因片段,就是不知道这个方向是如何确定的,希望能遇见大神指点迷津。感谢

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序列软件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下; 一个箭头表示一个ORF,箭头向左向右表示转录方向(同一基因簇中的不同ORF的转录是单独完成的,有的上链是正义链,有的下链是正义链)。
感谢,我现在是只有一窜测序后的基因序列,很长,如何知道这条链中不同的ORF的转录方向?
这个要自己来确定吧,有部分软件可以识别出一些常用的序列。未知序列得要自己来确认,然后在软件上进行标注。
非常感谢,那想知道未知序列的转录方向可以通过NCBI查看?还是....,现在有特定的方便查阅序列转录方向的网站或者软件吗?这些太深的东西我实在是刚接触,问的有点多
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如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对,根据匹配情况就可以判断是正链还是复链,不然就只能靠一些软件做预测了
感谢回复,你是说拿现有的序列进行tblastn?,这样可以看出正反链是吗?