应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 这种带箭头的基因图怎么做的？
81/1返回列表
查看: 2283  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者珊瑚海super将赠送您 100 个金币

珊瑚海super

木虫 (著名写手)

[求助] 这种带箭头的基因图怎么做的？ 已有2人参与

请教，这种带箭头的基因图是如何画出来的？用PPT？还是有专门的软件一键出图？上面的箭头长短我知道应该是基因片段的长度，但是方向如何确定？有的向左有的向右，整个序列其实是一条基因，上面有很多别的基因片段，就是不知道这个方向是如何确定的，希望能遇见大神指点迷津。感谢

这种带箭头的基因图怎么做的？
1.png@wizardfan@biostar2009
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-11-18 10:46:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingzhuang

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
序列软件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下； 一个箭头表示一个ORF，箭头向左向右表示转录方向（同一基因簇中的不同ORF的转录是单独完成的，有的上链是正义链，有的下链是正义链）。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

珊瑚海super
实验！成果！文章！毕业！工作！
2楼2020-11-18 11:37:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by dingzhuang at 2020-11-18 11:37:42
序列软件 DNAstar 、 SnapGene 了解一下； 一个箭头表示一个ORF，箭头向左向右表示转录方向（同一基因簇中的不同ORF的转录是单独完成的，有的上链是正义链，有的下链是正义链）。

感谢，我现在是只有一窜测序后的基因序列，很长，如何知道这条链中不同的ORF的转录方向？
赞一下 回复此楼
3楼2020-11-18 15:10:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jie123400

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 珊瑚海super at 2020-11-18 15:10:52
感谢，我现在是只有一窜测序后的基因序列，很长，如何知道这条链中不同的ORF的转录方向？...

这个要自己来确定吧，有部分软件可以识别出一些常用的序列。未知序列得要自己来确认，然后在软件上进行标注。
赞一下 回复此楼
4楼2020-11-18 16:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jie123400 at 2020-11-18 16:35:42
这个要自己来确定吧，有部分软件可以识别出一些常用的序列。未知序列得要自己来确认，然后在软件上进行标注。...

非常感谢，那想知道未知序列的转录方向可以通过NCBI查看？还是....，现在有特定的方便查阅序列转录方向的网站或者软件吗?这些太深的东西我实在是刚接触，问的有点多
赞一下 回复此楼
5楼2020-11-19 10:06:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

JY_Lee

新虫 (初入文坛)
如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对，根据匹配情况就可以判断是正链还是复链，不然就只能靠一些软件做预测了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

珊瑚海super
6楼2020-11-21 21:33:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

珊瑚海super

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by JY_Lee at 2020-11-21 21:33:07
如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对，根据匹配情况就可以判断是正链还是复链，不然就只能靠一些软件做预测了

感谢回复，你是说拿现有的序列进行tblastn?，这样可以看出正反链是吗？
赞一下 回复此楼
7楼2020-11-25 22:29:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

帕戴维

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by JY_Lee at 2020-11-21 21:33:07
如果已经有类似的序列的话可以做tblastn之类的进行比对，根据匹配情况就可以判断是正链还是复链，不然就只能靠一些软件做预测了

能否通过碱基序列判断，起始密码子和终止密码子

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2020-11-26 08:19:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 珊瑚海super 的主题更新
81/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿东华大学化学070300，求调剂 +5 2117205181 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:18 by ColorlessPI
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:04 by 搏击518
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +10 枫桥ZL 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:02 by peike
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 271材料工程求调剂 +8 .6lL 2026-03-18 8/400 2026-03-21 00:58 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +4 一志愿京区211 2026-03-18 6/300 2026-03-20 23:41 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 0854可跨调剂，一作一项核心论文五项专利，省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭