24小时热门版块排行榜    

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 订阅

管理团队 (金币库 69619.9 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成
2096691/210首页上一页899091929394下一页
全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
[热点] 国社科系统bug了，是不是要放榜了？ kynobel 2026-09-19 刚刚
[资源] [已完结]有虫友知道可以计算化合物分子的氢键受体和氢键供体的软件吗？？ (2/2470) 无言969 2016-01-22 2016-01-28 23:49:09 by s小木偶
[DS/Syby ] [已完结]大家好，我用下分子模拟软件，dock6.7已安装好，无法调用？ (评阅+1) (9/1237) xwnail2003 2016-01-24 2016-01-28 22:37:19 by xufund
[Gromacs ] [已完结][关贴]Unable to add (duplicate?) residue U:6 (0/679) momo5694 2016-01-28 2016-01-28 21:11:35 by momo5694
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps里面EAM-database工具合成的合金EAM问题 (1/929) weihui333 2015-09-23 2016-01-28 08:00:32 by liuchenhan
[资源] [已完结]求一篇全突变体多突变位点的英文文献 (0/621) lily_li 2016-01-27 2016-01-27 21:45:02 by lily_li
[其他] [已完结]ACD模拟碳谱结构 (0/351) 矿物学博士 2016-01-27 2016-01-27 21:10:39 by 矿物学博士
[DS/Syby ] [已完结]autodock vina 银原子无法识别怎么办 (1/1776) zuoan6474 2016-01-17 2016-01-27 14:14:26 by pymol
[DS/Syby ] [已完结]Discovory Studio 2.5 中文教程 (1/731) fri_秋 2015-12-23 2016-01-27 13:38:38 by 法官liu
[资源] [已完结]小伙伴，谁有IR光谱归属的软件VEDA，急需要这个软件，谢谢啦 (2/830) fuxianwei 2016-01-14 2016-01-27 13:32:20 by fuxianwei
[DS/Syby ] 【求助】请教大家DS 2.5对接结果分析    ( 1 2 ) (14/4274) lifei_dut 2010-08-17 2016-01-27 06:25:38 by wdali
[MS] [已完结]热力学计算！！！ (0/1444) 1135725495 2016-01-26 2016-01-26 15:46:39 by 1135725495
[DS/Syby ] 个人对SYBYL软件常见问题总结（原创，第一期）——会需更新中…… (评阅+11) (6/5417) 爱吃粉丝的猫 2015-09-17 2016-01-26 11:33:02 by 法官liu
[DS/Syby ] [已完结]DS分子对接新手求助，蛋白质除去水分子后对接出现0pose (1/1284) yangguaiw 2016-01-25 2016-01-26 11:00:27 by wdali
[Gromacs ] [已完结][关贴]如何生成自组装单分子层的PSF文件， (0/484) momo5694 2016-01-26 2016-01-26 10:29:41 by momo5694
[DS/Syby ] [已完结]新手求助！~~~如何使用DS模拟蛋白-蛋白接合？ (8/2270) ziecoe 2011-11-03 2016-01-26 06:53:34 by 雷童子
[其他] [已完结]zdock对接 (1/1383) zhouling1019 2016-01-25 2016-01-26 00:47:34 by donglili728
[其他] [已完结]求Gaussian 09安装步骤！！！ (5/1939) liuwei338 2016-01-20 2016-01-25 22:26:27 by liuwei338
[LAMMPS/ ] [已完结]LAMMPS中如何构建溶质原子随机分布的固溶体 (评阅+1) (6/3509) dyc_2008 2015-08-22 2016-01-25 19:35:39 by dyc_2008
[专家会诊] [已完结]autodock模拟酪氨酸酶与抑制剂的相互作用    ( 1 2 ) (13/1986) liujinbing_2007 2015-12-05 2016-01-25 16:34:39 by fmh1221
[其他] [已完结]Windows版2012的ADF安装教程 (0/830) jesson_922 2016-01-25 2016-01-25 13:18:12 by jesson_922
[LAMMPS/ ] [已完结]应当如何设置nvt nve npt 系综？ (6/4482) 完全是火 2016-01-23 2016-01-24 19:39:22 by 完全是火
[Gromacs ] [已完结]有没有人用Gromacs+Plumed算过Targeted MD? (1/1536) 00陨石00 2016-01-24 2016-01-24 18:54:19 by 00陨石00
[其他] [已完结]gaussian无错误退出计算 (0/535) 未央于一 2016-01-24 2016-01-24 16:42:03 by 未央于一
[MS] [已完结]求助建模 (7/939) 水影恋镜 2012-10-10 2016-01-24 08:31:42 by jjqaz
[MS] [已完结][关贴]求问~做对接时赋予力场的作用？ (1/480) Soledum 2016-01-20 2016-01-24 07:39:33 by zycz138
[MS] [已完结]加入grimme矫正会显著增加计算量吗？ (0/311) 竹清松瘦 2016-01-23 2016-01-23 11:13:05 by 竹清松瘦
[MS] [已完结]菜鸟求解答，如何用MS建粗糙壁面？求详细步骤，谢谢各位大神 (0/429) 15166575478 2016-01-23 2016-01-23 10:36:09 by 15166575478
[Gromacs ] [已完结]gromacs，对水分子的处理，如果mdp同时定义了-DFLEXIBLE和constraints=h-bonds (0/1148) 吉米爱多 2016-01-22 2016-01-22 19:40:06 by 吉米爱多
[MS] [已完结]MS粗粒化模拟, NPT-MD模拟所得轨迹很奇怪，模型一直往盒子外跑？ (8/1889) biancheng159 2015-11-07 2016-01-22 17:55:23 by 和小小小
[专家会诊] 好纠结的一个问题啊 (0/317) lcj09 2016-01-22 2016-01-22 16:25:27 by lcj09
[MS] [已完结]请教Na.pdb与Cl.pdb文件怎么写或者哪里可以下载到 (3/1311) 浅游学术海 2016-01-19 2016-01-22 15:56:32 by 浅游学术海
[资源] [已完结][关贴]表面修饰石墨烯 (0/429) tang_wei 2016-01-22 2016-01-22 15:34:36 by tang_wei
[LAMMPS/ ] 求一段小程序 (8/836) 米花花2 2016-01-21 2016-01-22 14:02:02 by 米花花2
[MS] [已完结]关于MS中的问题，急！ (5/1110) yy1408 2012-04-26 2016-01-22 13:28:27 by mystery_bai
[MS] [已完结]求助单晶Si的.cif文件 (0/556) sdusunli 2016-01-22 2016-01-22 09:07:40 by sdusunli
[MS] [已完结]求教氢离子建模与AC盒子问题    ( 1 2 ) (14/2091) kuaileniwo89 2015-06-03 2016-01-22 08:51:56 by snowislands
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]LAMMPS中Kspace_style命令 (0/3934) 645999667 2016-01-21 2016-01-21 22:14:48 by 645999667
[Gromacs ] [已完结]Gromacs能做金属氧化物纳米材料表面的蛋白质吸附的动力学模拟吗？ (2/920) huilovezhe 2016-01-21 2016-01-21 19:17:36 by huilovezhe
[Gromacs ] [已完结]超算中心并行版Gromacs的安装 (6/2043) 吉米爱多 2015-09-16 2016-01-21 16:23:26 by 赵红霞
[专家会诊] [已完结]Towhee模拟二元溶液气液平衡 (1/719) sys_gintama 2015-12-09 2016-01-21 10:09:54 by 杨文超
[MS] [已完结]MS中进行castap计算能带及态密度时状态一直显示setup，，， (1/786) 我是我很简单 2015-10-20 2016-01-21 09:58:52 by huangye2001
[MS] [已完结]硅烯建模问题 (4/2686) ldj168168 2014-11-06 2016-01-21 08:05:12 by jjqaz
[Gromacs ] [已完结]跪求Amber软件的MM-PBSA怎么进行能量分解？    ( 1 2 ) (15/2696) 背包旅客 2015-11-09 2016-01-20 20:49:56 by hdx1991
[MS] [已完结][关贴]MS模块Amorphous    ( 1 2 ) (评阅+1) (12/1605) xysxys 2016-01-19 2016-01-20 16:13:27 by Dr_Jesse
[Gromacs ] [已完结]gromacs无法生成gro文件 (5/3230) 牧雪长空 2013-01-21 2016-01-20 14:12:27 by 张德涛
[Gromacs ] [已完结]GROMACS跑完动力学后RDF分析和二面角随时间的变化 (0/1371) jws101 2016-01-20 2016-01-20 10:56:46 by jws101
[MS] [已完结]MS8.0总是自动退出 (0/282) xysxys 2016-01-20 2016-01-20 10:48:25 by xysxys
[LAMMPS/ ] [已完结]怎么用MS建立如下的data数据文件？在线等 求赐教 (8/2163) 刺青TS 2016-01-14 2016-01-20 10:47:31 by 刺青TS
[DS/Syby ] [已完结]zinc数据库中的小分子文件sdf下载后的使用问题 (3/2222) me_creazy 2016-01-06 2016-01-20 10:31:23 by me_creazy
[MS] [已完结]软件培训课程 (2/544) 冰剑泠璎 2016-01-19 2016-01-20 08:50:10 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结]请教 XP下lammps的输出问题 (4/1719) luomia 2012-10-18 2016-01-20 06:34:35 by leoluode
[LAMMPS/ ] [已完结]关于fix wall的用法 (0/1066) 11B329 2016-01-19 2016-01-19 22:06:45 by 11B329
[专家会诊] [已完结]HF/6-311++（d，p）和MP2/6-31，哪个计算能量精确一点。 (0/312) gaoningning1 2016-01-19 2016-01-19 18:42:22 by gaoningning1
[DS/Syby ] [已完结]求适用于win8的Accelrys Discovery Studio版本 (4/1872) sp20104499 2015-09-04 2016-01-19 18:39:25 by blwang1021
[CPMD/CP ] [已完结]关于cpmd2cube的问题 (5/2011) wangcui2011 2011-08-19 2016-01-19 17:17:21 by jbn1002
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps MP法求热导率,为何体系的温度下降了。 (1/1476) 雪雨星风17 2015-04-10 2016-01-19 16:23:38 by 电容2016
[MS] [已完结]用分子动力学来模拟超临界乙醇 (0/413) zh8888885 2016-01-19 2016-01-19 14:59:37 by zh8888885
[其他] 【求助】分子动力学模拟源代码    ( 1 2 ) (11/3714) zlzen 2010-12-06 2016-01-19 07:24:47 by dgwfly
[LAMMPS/ ] [已完结]菜鸟求教，LAMMPS中in 文件中的units lj 代表什么含义？ (5/2538) 完全是火 2016-01-13 2016-01-18 19:52:08 by cuihuina
[LAMMPS/ ] [已完结]不同速率降温 (1/687) 11B329 2016-01-18 2016-01-18 17:12:33 by tang_wei
[LAMMPS/ ] [已完结]求问cluster中键长和配位数统计用什么软件 (评阅+1) (6/2327) naterriver 2014-06-23 2016-01-18 14:12:15 by 亦幻亦真1314
[已完结]我在“中国博士后网上办公系统”填进站申请，为什么“是否进行在... (0/1620) 小五卡尼 2016-01-18 2016-01-18 13:39:45 by 小五卡尼
[其他] [已完结]Pymol的作图技巧 (4/1878) wjwangjuan 2016-01-16 2016-01-18 09:59:42 by wjwangjuan
[LAMMPS/ ] [已完结]关于缺陷表面建模 (评阅+1) (0/299) 11B329 2016-01-18 2016-01-18 07:45:47 by 11B329
[专家会诊] [已完结]求问pymol画多肽总电荷不为0 (5/1481) talent2 2015-10-24 2016-01-18 07:31:42 by me_creazy
[MS] [已完结]请问MS中哪个模块可以设置升温速率？？？    ( 1 2 3 4 ) (32/2676) tsklsakzb 2015-09-05 2016-01-18 07:18:56 by pigrass
[DS/Syby ] [已完结]酶的分子改造 (0/1400) dreamswing 2016-01-17 2016-01-17 23:03:31 by dreamswing
[DS/Syby ] 【求助】DS轨迹可以放到VMD吗 (3/727) yyx19840628 2010-01-30 2016-01-17 17:34:01 by yyx19840628
[MS] 在MS中如何添加力场 (2/2284) yksandzyj 2016-01-07 2016-01-17 14:57:28 by CQU_wjq
[MS] [已完结]discover计算错误，提示如下，我该怎么改呢？谢谢！ (4/1010) 橙子学术 2016-01-06 2016-01-17 14:52:14 by CQU_wjq
[Gromacs ] [已完结]gromacs的mdp文件中，有一个periodic-molecules选项，选yes还是no？ (0/1054) 吉米爱多 2016-01-17 2016-01-17 14:47:39 by 吉米爱多
[LAMMPS/ ] [已完结]fix 命令 (5/1059) hplc303 2016-01-14 2016-01-17 13:58:53 by hplc303
[DS/Syby ] [已完结]DS-分子对接求助 (1/1019) 珍维永久 2015-09-14 2016-01-16 11:30:33 by 柚小西
[其他] [已完结]刚性扫描两个噻吩分子之间的势能曲线，该怎么写gauss命令啊？ (评阅+1) (0/339) ylwang88 2016-01-16 2016-01-16 10:53:48 by ylwang88
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps中dump文件中原子顺序问题 (1/2761) 我爱bigbang 2016-01-15 2016-01-16 10:26:35 by tang_wei
[MS] 硒代甲硫氨酸残基 (4/1037) xuxul 2016-01-13 2016-01-16 09:19:19 by Soledum
[MS] [已完结]forcite与discover 对分子的dynamics计算有什么区别 (6/1354) yeahhanpei 2015-11-19 2016-01-15 20:35:41 by 韩旭辉
[MS] [已完结]求助：请问MS中可用的磷酸铁锂晶体结构是如何构建的？ (1/736) anmin0127 2015-12-28 2016-01-15 18:51:28 by 527816327
[MS] [已完结]MS7在Windows Server 2012系统下安装打不开，求解答 (0/323) white雪儿 2016-01-15 2016-01-15 17:14:45 by white雪儿
[LAMMPS/ ] [已完结]li/cut/coul/long与li/cut/coul/cut区别 (5/2481) 154/145* 2016-01-11 2016-01-15 16:18:47 by liuzhu0706
[MS] [已完结]MS模拟扩散系数时怎么全选气体分子分析均方位移 (8/3245) luoyiwei 2013-05-15 2016-01-15 13:04:49 by ljl7701496
[其他] [已完结]可以用什么软件来模拟单个有机分子的三维尺寸大小 (1/997) wyshujs 2016-01-13 2016-01-15 12:58:36 by 含能材料
[LAMMPS/ ] 势能函数的修正工作 (0/421) 645999667 2016-01-15 2016-01-15 11:50:54 by 645999667
[DS/Syby ] [已完结]为什么Raccoon无法设置输出路径？ (2/973) ruoqiu.xiao 2015-07-24 2016-01-15 11:04:20 by ruoqiu.xiao
[Gromacs ] [已完结]MMPBSA数据分析？IC50？ (0/1040) yuilyamada 2016-01-15 2016-01-15 09:28:55 by yuilyamada
[MS] [已完结]为何MS中计算的界面能还有负值呢 (8/3307) 长大小慧慧 2014-09-12 2016-01-15 08:19:10 by mituyang
[Gromacs ] [已完结]自由能求解 (6/1899) youngfi 2013-08-28 2016-01-15 05:41:18 by youngfi
[LAMMPS/ ] 【讨论】区分维里应力和柯西应力（周敏等）在文献中 (5/4067) hooge 2010-06-13 2016-01-15 00:21:21 by alundilong
[CPMD/CP ] [已完结]CPMD出错原因 (8/2052) nnipp 2011-10-28 2016-01-14 18:59:16 by jbn1002
[MS] 求助！在MS中建了MCM-41 模型 (0/333) 学员S3M3Vs 2016-01-14 2016-01-14 17:39:31 by 委员长中正
[MS] [已完结]求助，TiO2锐钛矿（101）面的Cluster，82个TiO2，应该怎么切啊 (8/1684) DevilCritian 2016-01-13 2016-01-14 17:02:50 by yiranfengbai
[DS/Syby ] [已完结]linux版的pyrx有人会安装吗？ (1/716) xufund 2015-12-16 2016-01-14 16:24:25 by bhulele
[DS/Syby ] [已完结]autodock对接时蛋白的处理问题 (6/3172) fjreading 2013-05-08 2016-01-14 15:43:23 by HMote
[MS] [已完结]求Fe-MOF-74.cif的文件 (0/2290) caoyangli7 2016-01-14 2016-01-14 13:41:37 by caoyangli7
[其他] [已完结][关贴]哪位大侠知道立方相CdS的晶胞参数，空间群和原子坐标，不胜感激 (1/906) hushaozheng 2016-01-14 2016-01-14 11:10:29 by cgl_012
[DS/Syby ] 对接中小分子的处理 (3/1054) 阿狸1205 2016-01-11 2016-01-14 09:02:58 by 阿狸1205
[其他] 请问大家有没有使用AMOEBA force field的？    ( 1 2 3 ) (25/2307) wang0912302 2016-01-13 2016-01-13 19:26:58 by sz_kebaoyuan
[MS] [已完结]先NVT后NVE的扩散系数计算 (评阅+1) (9/3980) mxbn55 2015-03-28 2016-01-13 17:28:20 by Awcse
2096691/210首页上一页899091929394下一页
相关版块跳转
查看