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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
19楼: Originally posted by liu1102yuan at 2015-09-07 09:52:28
50K/ps等升温速率在哪里设置?...

另外,我上面提到了pcff,按文献最好还是用dreiding吧
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
21楼2015-09-07 10:00:00
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liu1102yuan

木虫 (职业作家)

引用回帖:
20楼: Originally posted by pigrass at 2015-09-07 09:58:00
gulp好像是没办法设置的,我猜想只能350K dynamic 1ps后取最后一帧做400Kdynamic,这样手动做

我所了解的gulp做不到NEMD软件那种温度梯度的算法...

亲,麻烦您指导下如何把模型建立在周期性边界的中心位置
22楼2015-09-07 10:02:52
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
22楼: Originally posted by liu1102yuan at 2015-09-07 10:02:52
亲,麻烦您指导下如何把模型建立在周期性边界的中心位置...

结构是不是在中心不影响结果
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
23楼2015-09-07 10:07:28
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liu1102yuan

木虫 (职业作家)

引用回帖:
23楼: Originally posted by pigrass at 2015-09-07 10:07:28
结构是不是在中心不影响结果...

可是不太美观吖。亲,应助我好给BB
24楼2015-09-07 10:11:27
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

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24楼: Originally posted by liu1102yuan at 2015-09-07 10:11:27
可是不太美观吖。亲,应助我好给BB...

……选中所有分子链,shift+alt+右键拖动
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
25楼2015-09-07 10:18:19
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liu1102yuan

木虫 (职业作家)

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25楼: Originally posted by pigrass at 2015-09-07 10:18:19
……选中所有分子链,shift+alt+右键拖动...

我的天,我咋把这个忘记了,谢谢亲。应助吧
26楼2015-09-07 10:22:18
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

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26楼: Originally posted by liu1102yuan at 2015-09-07 10:22:18
我的天,我咋把这个忘记了,谢谢亲。应助吧...

不用了 这个帖子我应助够多了 金币留着以后应助吧

reaxff我没用过,你摸索下,我不知道用完会有什么样的结果显示
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
27楼2015-09-07 10:30:43
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liu1102yuan

木虫 (职业作家)

引用回帖:
25楼: Originally posted by pigrass at 2015-09-07 10:18:19
……选中所有分子链,shift+alt+右键拖动...

亲,电荷分配方式:use current和forcefield assigned有什么区别啊
28楼2015-09-07 10:31:00
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liu1102yuan

木虫 (职业作家)

引用回帖:
27楼: Originally posted by pigrass at 2015-09-07 10:30:43
不用了 这个帖子我应助够多了 金币留着以后应助吧

reaxff我没用过,你摸索下,我不知道用完会有什么样的结果显示...

谢谢亲,好人一生平安哈
29楼2015-09-07 10:34:30
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
28楼: Originally posted by liu1102yuan at 2015-09-07 10:31:00
亲,电荷分配方式:use current和forcefield assigned有什么区别啊...

use current是按你现在各个原子的电荷分配,不做改动
forcefield assigned是力场判断你的C原子属于什么类型,自动分配电荷
一般开始结构优化的时候用forcefield assigned,优化完原子就分配好合适的电荷了,之后就可以用use current了
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
30楼2015-09-07 10:40:12
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