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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 求问pymol画多肽总电荷不为0
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talent2

金虫 (著名写手)

[求助] 求问pymol画多肽总电荷不为0 已有2人参与

我想用pymol画一条多肽，15个氨基酸，画好了后面做计算的时候总是显示“total charge was not 0".
想版上达人请教，如能帮我画一个，不胜感激！
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1楼 2015-10-24 18:14:33
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shale1983

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
您是需要多肽结构还是要计算多肽的净电荷？chemdrew 不是可以画的吗？

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2楼2015-10-24 18:32:38
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MHSW

禁言 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
本帖内容被屏蔽
3楼2015-10-24 18:59:42
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talent2

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shale1983 at 2015-10-24 18:32:38
您是需要多肽结构还是要计算多肽的净电荷？chemdrew 不是可以画的吗？

您好，chemdraw画的用chem3d转成pdb的格式，计算软件识别不出来，我用的是gromacs计算。
请问您是否了解？谢谢！
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4楼2015-10-24 20:01:15
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shale1983

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这个软件没用过，但是如果小何计算多肽的净电荷好像也不需要画结构的看看氨基酸序列就行了，网上有网站可以计算的。

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5楼2015-10-24 20:23:21
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me_creazy

新虫 (正式写手)
请教一下，pymol和chemdraw都可以来画多肽结构吗？多肽画完后，二级结构如何显示？
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6楼2016-01-18 10:31:42
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