应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 怎么用MS建立如下的data数据文件？在线等 求赐教
91/1返回列表
查看: 2153  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

刺青TS

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么用MS建立如下的data数据文件？在线等 求赐教 已有2人参与

Comment line

        2158 atoms
           0 bonds
           0 angles
           0 dihedrals
           0 impropers

           2 atom types
           0 bond types
           0 angle types
           0 dihedral types
           0 improper types

   -100.0000000000000   100.00000000000       xlo xhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       ylo yhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       zlo zhi
  0.0 0.0 0.0 xy xz yz

Masses

   1  63.550
   2  12.011150

Atoms

1     1  -11.524229263   -8.133075000  -20.784525000
2     1   -9.716879263   -8.133075000  -22.591875000
3     1   -7.909529263   -8.133075000  -20.784525000
4     1   -6.102179263   -8.133075000  -22.591875000
5     1   -4.294829263   -8.133075000  -20.784525000
6     1   -2.487479263   -8.133075000  -22.591875000
7     1   -0.680129263   -8.133075000  -20.784525000
8     1    1.127220737   -8.133075000  -22.591875000
9     1    2.934570737   -8.133075000  -20.784525000
10    1    4.741920737   -8.133075000  -22.591875000
11    1  -11.524229263   -6.325725000  -22.591875000
12    1  -11.524229263   -4.518375000  -20.78452500
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

刺青TS

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-01-14 14:43:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MS导出相应模型的car和mdf文件，然后使用msi2lmp文件转换；或者导入到VMD里面，使用命令 topo writelammpsdata data.文件名
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-14 16:02:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 16:02:29
MS导出相应模型的car和mdf文件，然后使用msi2lmp文件转换；或者导入到VMD里面，使用命令 topo writelammpsdata data.文件名

可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗？

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-14 16:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-14 16:53:28
可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗？
...

不行，car文件只有坐标信息，那些bond等topo结构信息都没有
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

刺青TS
4楼2016-01-14 20:54:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 20:54:34
不行，car文件只有坐标信息，那些bond等topo结构信息都没有...

谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
5楼2016-01-15 12:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

[求学达人]

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-15 12:50:20
谢谢
...

请问楼主用ms的教程吗？能给小弟一份吗？万分感激！
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-15 15:56:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by [求学达人] at 2016-01-15 15:56:03
请问楼主用ms的教程吗？能给小弟一份吗？万分感激！...

我也没有教程也是刚来学习，不好意思

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-01-16 16:27:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

本帖仅楼主可见
赞一下
8楼2016-01-19 23:26:47
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

刺青TS

新虫 (小有名气)
送红花一朵
万分感谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
9楼2016-01-20 10:47:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 刺青TS 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 3/150 2026-08-29 03:23 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +3 gouxfjh 2026-08-28 3/150 2026-08-29 01:01 by jurkat.1640
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭