24小时热门版块排行榜    

查看: 1891  |  回复: 8

刺青TS

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么用MS建立如下的data数据文件?在线等 求赐教 已有2人参与

Comment line

        2158 atoms
           0 bonds
           0 angles
           0 dihedrals
           0 impropers

           2 atom types
           0 bond types
           0 angle types
           0 dihedral types
           0 improper types

   -100.0000000000000   100.00000000000       xlo xhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       ylo yhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       zlo zhi
  0.0 0.0 0.0 xy xz yz

Masses

   1  63.550
   2  12.011150

Atoms

1     1  -11.524229263   -8.133075000  -20.784525000
2     1   -9.716879263   -8.133075000  -22.591875000
3     1   -7.909529263   -8.133075000  -20.784525000
4     1   -6.102179263   -8.133075000  -22.591875000
5     1   -4.294829263   -8.133075000  -20.784525000
6     1   -2.487479263   -8.133075000  -22.591875000
7     1   -0.680129263   -8.133075000  -20.784525000
8     1    1.127220737   -8.133075000  -22.591875000
9     1    2.934570737   -8.133075000  -20.784525000
10    1    4.741920737   -8.133075000  -22.591875000
11    1  -11.524229263   -6.325725000  -22.591875000
12    1  -11.524229263   -4.518375000  -20.78452500
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
MS导出相应模型的car和mdf文件,然后使用msi2lmp文件转换;或者导入到VMD里面,使用命令 topo writelammpsdata data.文件名
2楼2016-01-14 16:02:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 16:02:29
MS导出相应模型的car和mdf文件,然后使用msi2lmp文件转换;或者导入到VMD里面,使用命令 topo writelammpsdata data.文件名

可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗?

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-01-14 16:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-14 16:53:28
可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗?
...

不行,car文件只有坐标信息,那些bond等topo结构信息都没有

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-01-14 20:54:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 20:54:34
不行,car文件只有坐标信息,那些bond等topo结构信息都没有...

谢谢

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-15 12:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

[求学达人]

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-15 12:50:20
谢谢
...

请问楼主用ms的教程吗?能给小弟一份吗?万分感激!
6楼2016-01-15 15:56:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by [求学达人] at 2016-01-15 15:56:03
请问楼主用ms的教程吗?能给小弟一份吗?万分感激!...

我也没有教程也是刚来学习,不好意思

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-01-16 16:27:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

本帖仅楼主可见
8楼2016-01-19 23:26:47
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

刺青TS

新虫 (小有名气)

送红花一朵
9楼2016-01-20 10:47:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 刺青TS 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:47 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 5/250 2026-02-08 08:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:27 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:26 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:12 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:07 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 08:06 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:52 by vs90ilomwc
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:46 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:32 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:27 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:26 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:07 by vs90ilomwc
[硕博家园] 博士延得我,科研能力直往上蹿 +8 偏振片 2026-02-02 8/400 2026-02-08 06:52 by liyeqik
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人) +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生|MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
请填处理意见