应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 怎么用MS建立如下的data数据文件？在线等 求赐教
91/1返回列表
查看: 2115  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

刺青TS

新虫 (小有名气)

[求助] 怎么用MS建立如下的data数据文件？在线等 求赐教 已有2人参与

Comment line

        2158 atoms
           0 bonds
           0 angles
           0 dihedrals
           0 impropers

           2 atom types
           0 bond types
           0 angle types
           0 dihedral types
           0 improper types

   -100.0000000000000   100.00000000000       xlo xhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       ylo yhi
   -100.0000000000000   100.00000000000       zlo zhi
  0.0 0.0 0.0 xy xz yz

Masses

   1  63.550
   2  12.011150

Atoms

1     1  -11.524229263   -8.133075000  -20.784525000
2     1   -9.716879263   -8.133075000  -22.591875000
3     1   -7.909529263   -8.133075000  -20.784525000
4     1   -6.102179263   -8.133075000  -22.591875000
5     1   -4.294829263   -8.133075000  -20.784525000
6     1   -2.487479263   -8.133075000  -22.591875000
7     1   -0.680129263   -8.133075000  -20.784525000
8     1    1.127220737   -8.133075000  -22.591875000
9     1    2.934570737   -8.133075000  -20.784525000
10    1    4.741920737   -8.133075000  -22.591875000
11    1  -11.524229263   -6.325725000  -22.591875000
12    1  -11.524229263   -4.518375000  -20.78452500
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

刺青TS

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2016-01-14 14:43:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
MS导出相应模型的car和mdf文件，然后使用msi2lmp文件转换；或者导入到VMD里面，使用命令 topo writelammpsdata data.文件名
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-14 16:02:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 16:02:29
MS导出相应模型的car和mdf文件，然后使用msi2lmp文件转换；或者导入到VMD里面，使用命令 topo writelammpsdata data.文件名

可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗？

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-14 16:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tang_wei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-14 16:53:28
可以自己通过ultraedit软件来打开car文件然后写出data文件吗？
...

不行，car文件只有坐标信息，那些bond等topo结构信息都没有
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

刺青TS
4楼2016-01-14 20:54:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by tang_wei at 2016-01-14 20:54:34
不行，car文件只有坐标信息，那些bond等topo结构信息都没有...

谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
5楼2016-01-15 12:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

[求学达人]

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 刺青TS at 2016-01-15 12:50:20
谢谢
...

请问楼主用ms的教程吗？能给小弟一份吗？万分感激！
赞一下 回复此楼
6楼2016-01-15 15:56:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

刺青TS

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by [求学达人] at 2016-01-15 15:56:03
请问楼主用ms的教程吗？能给小弟一份吗？万分感激！...

我也没有教程也是刚来学习，不好意思

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-01-16 16:27:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

本帖仅楼主可见
赞一下
8楼2016-01-19 23:26:47
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

刺青TS

新虫 (小有名气)
送红花一朵
万分感谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
9楼2016-01-20 10:47:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 刺青TS 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:22 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +5 a089 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:04 by alian_214
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[找工作] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 10:39 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] fileCode有新解读？ +8 Tide man 2026-08-08 16/800 2026-08-08 09:59 by Tide man
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭