应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
161/2返回列表12下一页
查看: 2659  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

默默的小虫

木虫 (正式写手)

[求助] 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢 已有4人参与

大家好：
我在用MS中的CASTEP模块做表面吸附计算，但是结构优化自己所建立的层状模型（slab）后，发现slab model 中的原子显示有缺失，但是实际上那些地方是有原子的，如下图，求大神指教，该怎么处理，才能让所有的原子显示啊

请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
1CZH97J[K2HTGSRGA7(6F00.png
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-01-25 16:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by xiaowandouer at 2016-04-27 19:46:56
楼主这个问题最后怎么解决的啊？能否此帖中再介绍下你的经验？

我遇到的问题是，original方式显示正确，其他方式都有原子缺失。

将display中的Min调小些比如-0.01或-0.02，Max 调到1.01或1.02就可以了
赞一下(2人) 回复此楼
15楼2016-04-28 08:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)
是不是跑到别的地方去啦 你扩展晶胞看看 还是就是可能软件装的有问题
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-26 17:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

miss_jerry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:51:02
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:52:08
默默的小虫: 金币+2 2016-02-19 10:28:44
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:12
右键display style->lattice style-> in cell
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-27 07:44:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

你好，我看过构型，并没有跑出晶格，而且我将slab model 在a方向扩张之后，那里显示有原子

我之前就用CASTEP算过，只不过计算精度较低，现在采用高精度计算后，就出现这种现象了，搞不懂怎么处理啊

还有没有其他的方法啊
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-27 09:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

LVJ1987

铁虫 (初入文坛)
应该是没问题的，

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
5楼2016-02-11 10:58:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
默默的小虫: 金币+4, ★有帮助 2016-02-19 09:01:01
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:18
就只是因为周期性而已，没什么影响，如果你想要避免这种情况的话，可以在计算之前对整体平移一定距离，使结构其远离边界

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-02-11 15:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
7楼2016-02-11 17:30:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloverliang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:23
这是正常现象，我也遇过，因为经过几何优化，键长变大，原子跑到下一个周期去了
赞一下 回复此楼
8楼2016-02-18 23:54:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

试过了，没用
回复此楼
9楼2016-02-19 08:58:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chimegreen at 2016-02-11 17:30:41
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

这个键长不是优化之后的结果吗，调整它，不是结果就不对了啊！？
赞一下 回复此楼
10楼2016-02-19 08:59:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 默默的小虫 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 05:45 by gy1nBQXYQJqL
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 05:13 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +4 gouxfjh 2026-08-28 4/200 2026-08-29 04:46 by alongwaytogo
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[职场人生] 学生撞见辅导员送外卖，第二天全班都沉默了 +3 鲸鱼融金_浙江_� 2026-08-22 3/150 2026-08-26 09:01 by zzuzxg
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭