应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
161/2返回列表12下一页
查看: 2369  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

默默的小虫

木虫 (正式写手)

[求助] 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢 已有4人参与

大家好：
我在用MS中的CASTEP模块做表面吸附计算，但是结构优化自己所建立的层状模型（slab）后，发现slab model 中的原子显示有缺失，但是实际上那些地方是有原子的，如下图，求大神指教，该怎么处理，才能让所有的原子显示啊

请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
1CZH97J[K2HTGSRGA7(6F00.png
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-01-25 16:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by xiaowandouer at 2016-04-27 19:46:56
楼主这个问题最后怎么解决的啊？能否此帖中再介绍下你的经验？

我遇到的问题是，original方式显示正确，其他方式都有原子缺失。

将display中的Min调小些比如-0.01或-0.02，Max 调到1.01或1.02就可以了
赞一下(2人) 回复此楼
15楼2016-04-28 08:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)
是不是跑到别的地方去啦 你扩展晶胞看看 还是就是可能软件装的有问题
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-26 17:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

miss_jerry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:51:02
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:52:08
默默的小虫: 金币+2 2016-02-19 10:28:44
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:12
右键display style->lattice style-> in cell
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-27 07:44:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

你好，我看过构型，并没有跑出晶格，而且我将slab model 在a方向扩张之后，那里显示有原子

我之前就用CASTEP算过，只不过计算精度较低，现在采用高精度计算后，就出现这种现象了，搞不懂怎么处理啊

还有没有其他的方法啊
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-27 09:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

LVJ1987

铁虫 (初入文坛)
应该是没问题的，

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
5楼2016-02-11 10:58:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
默默的小虫: 金币+4, ★有帮助 2016-02-19 09:01:01
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:18
就只是因为周期性而已，没什么影响，如果你想要避免这种情况的话，可以在计算之前对整体平移一定距离，使结构其远离边界

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-02-11 15:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
7楼2016-02-11 17:30:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloverliang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:23
这是正常现象，我也遇过，因为经过几何优化，键长变大，原子跑到下一个周期去了
赞一下 回复此楼
8楼2016-02-18 23:54:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

试过了，没用
回复此楼
9楼2016-02-19 08:58:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chimegreen at 2016-02-11 17:30:41
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

这个键长不是优化之后的结果吗，调整它，不是结果就不对了啊！？
赞一下 回复此楼
10楼2016-02-19 08:59:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 默默的小虫 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:39 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 0805材料320求调剂 +3 深海物语 2026-03-20 3/150 2026-03-21 15:46 by 无际的草原
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕，总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 +8 安全上岸！ 2026-03-16 8/400 2026-03-20 22:13 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 招收调剂硕士 +4 lidianxing 2026-03-19 12/600 2026-03-20 12:25 by lidianxing
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 【同济软件】软件（085405）考研求调剂 +3 2026eternal 2026-03-18 3/150 2026-03-18 19:09 by 搏击518
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭