应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
161/2返回列表12下一页
查看: 2331  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

默默的小虫

木虫 (正式写手)

[求助] 请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢 已有4人参与

大家好：
我在用MS中的CASTEP模块做表面吸附计算，但是结构优化自己所建立的层状模型（slab）后，发现slab model 中的原子显示有缺失，但是实际上那些地方是有原子的，如下图，求大神指教，该怎么处理，才能让所有的原子显示啊

请问我在CASTEP中优化自己所建立的层状模型后，发现原子显示 不完全，该怎么处理呢
1CZH97J[K2HTGSRGA7(6F00.png
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2016-01-25 16:34:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by xiaowandouer at 2016-04-27 19:46:56
楼主这个问题最后怎么解决的啊？能否此帖中再介绍下你的经验？

我遇到的问题是，original方式显示正确，其他方式都有原子缺失。

将display中的Min调小些比如-0.01或-0.02，Max 调到1.01或1.02就可以了
赞一下(2人) 回复此楼
15楼2016-04-28 08:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

小雨熊

木虫 (正式写手)
是不是跑到别的地方去啦 你扩展晶胞看看 还是就是可能软件装的有问题
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-26 17:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

miss_jerry

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:51:02
默默的小虫: 金币+2 2016-01-27 09:52:08
默默的小虫: 金币+2 2016-02-19 10:28:44
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:12
右键display style->lattice style-> in cell
赞一下 回复此楼
3楼2016-01-27 07:44:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

你好，我看过构型，并没有跑出晶格，而且我将slab model 在a方向扩张之后，那里显示有原子

我之前就用CASTEP算过，只不过计算精度较低，现在采用高精度计算后，就出现这种现象了，搞不懂怎么处理啊

还有没有其他的方法啊
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-27 09:52:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

LVJ1987

铁虫 (初入文坛)
应该是没问题的，

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
5楼2016-02-11 10:58:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
默默的小虫: 金币+4, ★有帮助 2016-02-19 09:01:01
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:18
就只是因为周期性而已，没什么影响，如果你想要避免这种情况的话，可以在计算之前对整体平移一定距离，使结构其远离边界

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-02-11 15:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chimegreen

木虫 (正式写手)

Dr.
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
快乐科研，快乐生活。
7楼2016-02-11 17:30:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cloverliang

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-02-24 14:55:23
这是正常现象，我也遇过，因为经过几何优化，键长变大，原子跑到下一个周期去了
赞一下 回复此楼
8楼2016-02-18 23:54:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by miss_jerry at 2016-01-27 07:44:32
右键display style->lattice style-> in cell

试过了，没用
回复此楼
9楼2016-02-19 08:58:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

默默的小虫

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chimegreen at 2016-02-11 17:30:41
接着三楼说的，in cell以后再调整回来。还可以试试调节一下bond

这个键长不是优化之后的结果吗，调整它，不是结果就不对了啊！？
赞一下 回复此楼
10楼2016-02-19 08:59:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 默默的小虫 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:46 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 5/250 2026-02-08 08:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 08:27 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:26 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:12 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 08:07 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:52 by vs90ilomwc
[找工作] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:46 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:32 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:27 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:07 by vs90ilomwc
[硕博家园] 博士延得我，科研能力直往上蹿 +8 偏振片 2026-02-02 8/400 2026-02-08 06:52 by liyeqik
[教师之家] 有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人） +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭