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[请教]关于用MS建立晶体模型的若干问题
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各位大侠高手，我不是做化学方面的，要利用Dmol3计算下某些晶体的频率情况。最近看了一些关于MS的教程。有几个问题，可能比较外行，望知道的同学不吝赐教。 我想计算萘Naphthalene晶体的频率-吸收特性。在MS自带的一些物质中，有萘，但帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1339385中说，这个是单斜晶胞。于是我又学论坛中的方法来建立晶体模型，主要学习和使用如下两篇帖子的方法http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1967925和muchong.com/html/201107/3421244.html 但是获得的结果，总感觉不大正确，因为例子中的物质不是有机物分子晶体，所以我觉得我依葫芦画瓢做的不一定对。 想请教下，建立晶体的各步骤中的参数应该怎么设置比较合适。 第一步Built——surface——cleave surface，cleave我选的是-1 0 0（不知道对不对），thickness原子层厚度这里两个数值应该怎么设置比较好呢？ 第二步Symmetry——supercell，这里有ABC三个range，还是如何设置比较好？ 最后，Vacuum thickness选择多少比较合适？ 希望各位帮帮忙，万分感激。 |
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