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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 纤维素晶体结构建模
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仇小仇

铁虫 (初入文坛)

[求助] 纤维素晶体结构建模

大家好 本人刚刚接触这个领域 原来也不是这个专业的 很多东西都不明白 导师给了方向就让研究这个 也没人指导只能自己摸索，想问一下大家 用MS构建纤维素Iβ晶体模型 是首先构建一个晶胞 然后add atom么？ 但是纤维素Iβ应该是一条长链呀 构建出来的只是两个分离的1,4bD 分子呀 并没有成链呀  还是应高先构建成链然后再放入晶胞中呢？很着急 老师又催 谢谢大家了！
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学海无涯
1楼 2012-10-13 16:45:42
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

huangshuang1

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-15 08:49:37
你做切面可以放到盒子里，也可以做成链放到盒子里，都可以的
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6楼2012-10-15 08:25:44
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o58285880

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 仇小仇 at 2012-10-14 15:26:03
非常感谢 刚刚接触这个专业 可以说是0基础 还想再问一下 看了一篇晶体建模的文章 说是要cleave surface 然后supercell 那是不是就不能只是放进盒子里去就可以了呢？  万分感谢您的回答！！...

这个就不能直接放进去了，最好是按部就班来。但是可以偷懒么纤维素模型切面做出来后，做个2乘2 或者4乘4的放大，再做P1不就可以了么。  底物变大了么，而却还是连续的表面。就好看点，其实没啥用。
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。。。。。。
7楼2012-10-15 12:15:58
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普通回帖

o58285880

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-14 10:01:32
如果不做晶体切面的话，画好以后直接扔盒子是可以的。 建议去看看教材吧，先把软件弄扎实了，后面试验很快。
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仇小仇
。。。。。。
2楼2012-10-13 21:50:47
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仇小仇

铁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by o58285880 at 2012-10-13 21:50:47
如果不做晶体切面的话，画好以后直接扔盒子是可以的。 建议去看看教材吧，先把软件弄扎实了，后面试验很快。

谢谢啊 请问一下是怎么扔进盒子里去的呢？ 每一个原子在盒子中应该是有自己的坐标的 那放进去之后 怎么使原子的位置正好在相应的坐标上呢？ 教材？是在网上自己下么？
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学海无涯
3楼2012-10-14 10:19:43
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o58285880

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-10-14 10:41:06
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-15 08:49:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by 仇小仇 at 2012-10-14 10:19:43
谢谢啊 请问一下是怎么扔进盒子里去的呢？ 每一个原子在盒子中应该是有自己的坐标的 那放进去之后 怎么使原子的位置正好在相应的坐标上呢？ 教材？是在网上自己下么？...

做个P1的盒子就可以直接放进去。教材很多啊 去看看前面的资源帖，可以下的到，很多软件的教材都有如何建立晶体，以及如何处理模型的教程。
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仇小仇
。。。。。。
4楼2012-10-14 10:35:56
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仇小仇

铁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by o58285880 at 2012-10-14 10:35:56
做个P1的盒子就可以直接放进去。教材很多啊 去看看前面的资源帖，可以下的到，很多软件的教材都有如何建立晶体，以及如何处理模型的教程。...

非常感谢 刚刚接触这个专业 可以说是0基础 还想再问一下 看了一篇晶体建模的文章 说是要cleave surface 然后supercell 那是不是就不能只是放进盒子里去就可以了呢？  万分感谢您的回答！！
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学海无涯
5楼2012-10-14 15:26:03
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xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头
楼主，纤维素结构有吗？我也准备画，但是不知道从何下手，求指导
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8楼2014-12-01 21:58:43
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Edison=Wang

新虫 (初入文坛)
楼主，纤维素结构有吗？新手刚入门，945305065@qq.com，多谢！
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9楼2015-08-06 10:41:42
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独孤麦芒

金虫 (初入文坛)
送红花一朵
楼主，纤维素结构有吗？新手刚入门，550113460@qq.com，多谢！
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10楼2017-01-03 10:34:19
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