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仇小仇

铁虫 (初入文坛)

[求助] 纤维素晶体结构建模

大家好 本人刚刚接触这个领域 原来也不是这个专业的 很多东西都不明白 导师给了方向就让研究这个 也没人指导只能自己摸索,想问一下大家 用MS构建纤维素Iβ晶体模型 是首先构建一个晶胞 然后add atom么? 但是纤维素Iβ应该是一条长链呀 构建出来的只是两个分离的1,4bD 分子呀 并没有成链呀  还是应高先构建成链然后再放入晶胞中呢?很着急 老师又催 谢谢大家了!
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学海无涯
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huangshuang1

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-15 08:49:37
你做切面可以放到盒子里,也可以做成链放到盒子里,都可以的
6楼2012-10-15 08:25:44
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o58285880

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 仇小仇 at 2012-10-14 15:26:03
非常感谢 刚刚接触这个专业 可以说是0基础 还想再问一下 看了一篇晶体建模的文章 说是要cleave surface 然后supercell 那是不是就不能只是放进盒子里去就可以了呢?  万分感谢您的回答!!...

这个就不能直接放进去了,最好是按部就班来。但是可以偷懒么纤维素模型切面做出来后,做个2乘2 或者4乘4的放大,再做P1不就可以了么。  底物变大了么,而却还是连续的表面。就好看点,其实没啥用。
。。。。。。
7楼2012-10-15 12:15:58
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普通回帖

o58285880

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-14 10:01:32
如果不做晶体切面的话,画好以后直接扔盒子是可以的。 建议去看看教材吧,先把软件弄扎实了,后面试验很快。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

。。。。。。
2楼2012-10-13 21:50:47
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仇小仇

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by o58285880 at 2012-10-13 21:50:47
如果不做晶体切面的话,画好以后直接扔盒子是可以的。 建议去看看教材吧,先把软件弄扎实了,后面试验很快。

谢谢啊 请问一下是怎么扔进盒子里去的呢? 每一个原子在盒子中应该是有自己的坐标的 那放进去之后 怎么使原子的位置正好在相应的坐标上呢? 教材?是在网上自己下么?
学海无涯
3楼2012-10-14 10:19:43
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o58285880

银虫 (小有名气)

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-10-14 10:41:06
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-15 08:49:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by 仇小仇 at 2012-10-14 10:19:43
谢谢啊 请问一下是怎么扔进盒子里去的呢? 每一个原子在盒子中应该是有自己的坐标的 那放进去之后 怎么使原子的位置正好在相应的坐标上呢? 教材?是在网上自己下么?...

做个P1的盒子就可以直接放进去。教材很多啊 去看看前面的资源帖,可以下的到,很多软件的教材都有如何建立晶体,以及如何处理模型的教程。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

。。。。。。
4楼2012-10-14 10:35:56
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仇小仇

铁虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by o58285880 at 2012-10-14 10:35:56
做个P1的盒子就可以直接放进去。教材很多啊 去看看前面的资源帖,可以下的到,很多软件的教材都有如何建立晶体,以及如何处理模型的教程。...

非常感谢 刚刚接触这个专业 可以说是0基础 还想再问一下 看了一篇晶体建模的文章 说是要cleave surface 然后supercell 那是不是就不能只是放进盒子里去就可以了呢?  万分感谢您的回答!!
学海无涯
5楼2012-10-14 15:26:03
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xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头

楼主,纤维素结构有吗?我也准备画,但是不知道从何下手,求指导
8楼2014-12-01 21:58:43
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Edison=Wang

新虫 (初入文坛)

楼主,纤维素结构有吗?新手刚入门,945305065@qq.com,多谢!
9楼2015-08-06 10:41:42
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独孤麦芒

金虫 (初入文坛)

送红花一朵
楼主,纤维素结构有吗?新手刚入门,550113460@qq.com,多谢!
10楼2017-01-03 10:34:19
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