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xfk274280

新虫 (初入文坛)

[求助] discovery studio2.5做同源建模和分子对接 ,金币不多求帮帮忙

做的胰蛋白酶抑制剂的同源建模和分子对接。在ds上做了以下步骤。对同源建模初始结构优化的时候出现了问题,用的standard dynamics cascade。后面后面三项时间设置都是5ps。结构优化后反而分数变低了。也分步骤做了standard dynamics cascade。平衡得出结果还好,最后一步production结构又变差了。还有最优构想是选择最后一个吗?分子对接部分,已经从pdb数据库上得到了胰蛋白酶,该用什么方法进行对接?金币不多求帮帮忙

discovery studio2.5做同源建模和分子对接 ,金币不多求帮帮忙
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

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2楼2016-01-29 15:44:19
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