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wangcui2011金虫 (小有名气)
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关于cpmd2cube的问题
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弱弱地问一下，我使用命令 cpmd2cube.x -dens -center --DENSITY 对文件DENSITY进行格式转换时，出现错误提示： could not find file --DENSITY 同样，用cpmd2cube.x -wave -center --WAVEFUNCTION.4对WAVEFUNCTION.4进行转换时，也出现错误： could not find file --WAVEFUNCTION.4 而以上文件确实存在。不知道究竟哪儿出错了。。。 是我的cpmd2cube程序未正确编译吗？ 希望高手给予指点，先谢谢啦！ |
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【答案】应助回帖
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wangcui2011(金币+2): 等了好久，终于有了一个明确的解答~太感谢了！再次谢谢指点 2011-09-16 10:15:54
ghcacj(金币+8): 谢谢 2011-09-16 13:09:48
wangcui2011(金币+2): 等了好久，终于有了一个明确的解答~太感谢了！再次谢谢指点 2011-09-16 10:15:54
ghcacj(金币+8): 谢谢 2011-09-16 13:09:48
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兄弟，去掉 -- cpmd2cube是这样用的： $cpmd2cube.x -dens -center DENSITY .read input file ... done I think you stored a density (sum^2 = 0.73398078E-03) .building g vectors ... done create pdb file DENSITY.pdb... done .handling file DENSITY real-space grid was: 70 70 70; using: 70 70 70 .calculate density ... done Integral|| = 1219.8565648868585 6748.3344962837027 343000 Integral() = 1219.8565648868585 6748.3344962837027 343000 creating cube file DENSITY.cube... done 然后， $ vmd DENSITY.cube 然后 菜单 - Graphics - representation - create rep - Drawing method选isosurface - siovalue选择0.01什么的，就可以看到华丽的盒子和电子云。  |
2楼2011-09-16 07:08:21
wangcui2011
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