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Gromacs/Amber/NAMD
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successhe
2026-02-21
刚刚
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MS
]
[关贴]
菜鸟请教,用Gaussian98W 做一个小分子构型优化的问题
(1/417)
rumingfeng
2013-06-15
2013-06-15 16:03:39
by
chaizhm
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资源
]
[已完结]
guassview教程
(5/2104)
dxj881216
2013-06-14
2013-06-15 16:00:01
by
chaizhm
[
其他
]
分子动力学中温度的问题
(5/2194)
relonfbq
2011-05-06
2013-06-15 12:33:09
by
relonfbq
[
DS/Syby
]
[求助]sybyl蛋白质准备时有6条链,怎么样才知道要去除哪些链啊?
(1/939)
catbanana
2013-06-13
2013-06-15 11:35:39
by
wwb168
[
Gromacs
]
[已完结]
g_dist 计算分子中的两个原子的距离,如何排除镜像?
(0/456)
mengsk
2013-06-15
2013-06-15 10:23:54
by
mengsk
[
其他
]
【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM谁最适合生物大分子模拟?
(评阅+1)
(8/4303)
yuankanxue
2010-10-30
2013-06-14 20:02:52
by
sauller
[
DS/Syby
]
[已完结]
请问怎么对DS中的对接结果进行分析呢?
(0/1710)
Qeason
2013-06-14
2013-06-14 18:49:01
by
Qeason
[
Gromacs
]
[已完结]
请问常见的力场,amber,charmm,oplsaa,gromos,amoeba中的参数
(2/1891)
haoguoyu
2013-06-06
2013-06-14 15:05:47
by
xzz1007
[
资源
]
[已完结]
SYBYL-X 教学视频
(0/696)
dxj881216
2013-06-14
2013-06-14 14:21:56
by
dxj881216
[
MS
]
[已完结]
Material studio 5.5
(5/1954)
紫嫣小小
2012-07-04
2013-06-14 14:06:53
by
090121326
[
DS/Syby
]
[已完结]
有用OpenEye做虚拟筛选的么?
(5/976)
sfcatener
2013-06-07
2013-06-14 11:37:43
by
xpyp
[
MS
]
[已完结]
结构精修求助
(0/300)
hkl910101
2013-06-14
2013-06-14 10:36:54
by
hkl910101
[
LAMMPS/
]
[已完结]
在此情况下选择什么系综,用什么lammps命令实现温度随时间线性升高
(2/1637)
范围份额
2013-06-11
2013-06-14 09:22:00
by
sciencejoy
[
其他
]
[已完结]
新人求助 生物大分子分子模拟用什么软件
(4/1446)
weizhenx
2011-10-09
2013-06-13 23:15:27
by
方蓝雨
[
专家会诊
]
[已完结]
蛋白质构象模拟
(
1
2
)
(12/1952)
liulovewang
2012-07-07
2013-06-13 23:14:18
by
方蓝雨
[
DS/Syby
]
【求助】急!autodock在windows下怎么进行对接啊?
(
1
2
)
(11/1710)
唐荣胜
2010-05-23
2013-06-13 17:50:40
by
shaye
[
MS
]
[已完结]
CASTEP几何优化计算running后不出结果
(0/1049)
奔跑的小鸟
2013-06-13
2013-06-13 15:07:56
by
奔跑的小鸟
[
Gromacs
]
【求助】namd tutorial遇到问题
(
1
2
)
(10/1622)
一步一步
2010-04-21
2013-06-13 15:00:43
by
homer_2005
[
Hyperch
]
[已完结]
怎样用高斯计算聚丙烯酸钠的分子构型
(1/790)
qchujw
2013-06-12
2013-06-13 11:02:21
by
sciencejoy
[
CPMD/CP
]
[已完结]
[关贴]
用CP2K计算64个氦原子体系的DFTMD,但是加入TDDFPT前后结果不变,谁知道是为什么?
(0/751)
hcgz11802
2013-06-13
2013-06-13 10:32:16
by
hcgz11802
[
DS/Syby
]
[已完结]
请问:autodock怎样运行脚本?
(2/741)
邓芳
2013-06-11
2013-06-12 21:31:50
by
邓芳
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助discovery studio 2.5 中文教程
(2/963)
cpf831125
2013-06-01
2013-06-12 13:38:29
by
windf1ower
[
MS
]
[已完结]
namd能量最小化完成后给我的十几个文件怎么没有pdb格式的呀
(6/2268)
nsaa001
2013-06-11
2013-06-12 09:53:30
by
broken1999
[
MS
]
[已完结]
麻烦计算一下这个小分子的大小
(1/986)
zhaomq
2013-06-12
2013-06-12 08:00:43
by
longytu
[
专家会诊
]
[已完结]
算三线态激发态时遇到从高轨道向低轨道的跃迁,是什么问题?
(0/723)
左边_在左边
2013-06-11
2013-06-11 23:11:48
by
左边_在左边
[
MS
]
[已完结]
既然NAMD是模拟多肽的结构,为什么有需要一个pdb文件作为input呢?
(4/1236)
nsaa001
2013-06-10
2013-06-11 14:15:59
by
fhh2626
[
MS
]
[已完结]
MS数据丢失
(0/251)
smx3120
2013-06-10
2013-06-10 15:05:57
by
smx3120
[
CPMD/CP
]
[已完结]
截断能 单位Ry 换算为eV?
(3/3785)
jianying8996
2013-06-08
2013-06-10 10:16:46
by
jianying8996
[
CPMD/CP
]
[已完结]
CPMD势文件不足如何解决?
(4/1492)
cenwanglai
2013-06-05
2013-06-09 21:25:40
by
一声叹息010
[
MS
]
[已完结]
动力学MSD分析
(0/1709)
yida
2013-06-09
2013-06-09 19:49:44
by
yida
[
CPMD/CP
]
[已完结]
CPMD RESTART
(1/1389)
akiyama
2013-03-13
2013-06-09 18:38:25
by
一声叹息010
[
其他
]
[已完结]
Pov-ray里面氨基酸label字体太小
(5/941)
vzai1234
2012-10-31
2013-06-09 18:23:02
by
yp_ping
[
LAMMPS/
]
LAMMPS温度控制----如何达到平衡态
(4/3053)
hasisjc
2013-05-09
2013-06-09 17:11:52
by
目光之城
[
Gromacs
]
[已完结]
Restrained Electrostatic Potential (RESP) method是用来做什么的?
(3/1187)
mengsk
2013-06-09
2013-06-09 16:48:24
by
yaozhq
[
MS
]
[已完结]
求助大侠用MS计算几个分子的内聚能和溶度参数
(1/922)
huonali
2013-06-06
2013-06-09 14:45:12
by
wylYolanda
[
MS
]
[已完结]
求MN的晶格数据或CIF或MSI文件
(0/226)
zou7758
2013-06-09
2013-06-09 11:05:30
by
zou7758
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
如何进行定点突变?以及突变后模型的评价
(1/719)
1054950560
2013-06-09
2013-06-09 10:55:22
by
Haibin_Liu
[
MS
]
[已完结]
求菱形氮化硼r-BN JCPDS No.45-1171的cif文件(R3m,No.160)
(3/902)
yxjing
2013-06-08
2013-06-09 08:59:37
by
yxjing
[
专家会诊
]
[已完结]
WHAM怎么做呢
(1/1426)
hyudlut
2013-06-08
2013-06-09 08:22:35
by
jiaoyixiong
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs计算时中途暂停,产生了很多的step文件,求解答
(2/1245)
蓝洛水seven
2013-05-22
2013-06-09 05:19:49
by
kindermoon
[
MS
]
[已完结]
求一个pure-metel的Mn的模型文件
(1/362)
zou7758
2013-06-08
2013-06-09 01:33:05
by
zou7758
[
LAMMPS/
]
MAPS多尺度材料设计平台 分子模拟理论与实践免费培训课程
(1/1533)
小丑鱼YY
2013-06-08
2013-06-08 17:33:23
by
xiaowu759
[
专家会诊
]
[已完结]
纳米压痕模拟,对于npt系综,设置恒温层还有意义吗?
(0/396)
heibeidedong
2013-06-08
2013-06-08 10:07:17
by
heibeidedong
[
ME/Gulp
]
[已完结]
分子动力学计算相图
(5/2185)
zggt
2012-11-15
2013-06-08 08:29:56
by
lei0736
[
Monte C
]
[已完结]
music 安装出现问题
(2/678)
yangisyoung
2013-06-06
2013-06-07 09:36:23
by
yangisyoung
[
MS
]
[已完结]
请教这个蛋白的loop
(2/1464)
111602
2013-06-07
2013-06-07 08:57:05
by
111602
[
专家会诊
]
[已完结]
[关贴]
版上谁有白云母的xyz文件,能不能发给我一份。谢谢!
(0/299)
Bessel
2013-06-07
2013-06-07 02:31:08
by
Bessel
[
MS
]
[已完结]
请教关于force extension curve的计算问题
(0/274)
angjzy
2013-06-06
2013-06-06 20:51:16
by
angjzy
[
MS
]
[已完结]
我建的这个模型是不是周期性体系?
(5/2025)
voleyes
2012-01-16
2013-06-06 16:29:11
by
heyang90313
[
LAMMPS/
]
[已完结]
LAMMPS安装问题
(2/831)
luyy1987
2013-06-06
2013-06-06 15:59:27
by
abinitio
[
Gromacs
]
[已完结]
如何截取一定范围内的水分子,并提取编号
(4/1014)
mojie1987
2013-05-09
2013-06-06 11:13:06
by
mojie1987
[
DS/Syby
]
用于虚拟筛选的化合物库有哪些,哪些是免费的?
(3/1636)
哀兵必胜
2013-05-05
2013-06-06 09:56:25
by
马可波罗001
[
MS
]
同一软件,不同的电脑为什么计算结果不同
(7/2705)
ywj1986
2013-06-04
2013-06-06 08:58:35
by
拓路
[
专家会诊
]
[已完结]
请问一步有500百万个原子的lammps构型文件用什么软件可以可视化显示?
(8/2283)
neaper
2013-06-04
2013-06-05 18:00:25
by
neaper
[
DS/Syby
]
[已完结]
求助,sybyl里面分子转换格式后存放的路径可以改吗?
(2/761)
catbanana
2013-06-05
2013-06-05 17:53:01
by
catbanana
[
其他
]
[已完结]
谁知道可以建对称性高些的模型的软件或者方法?
(5/815)
李路lulu
2013-06-03
2013-06-05 16:03:36
by
jiaoyixiong
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
补全蛋白残基
(1/1493)
angelhunte
2013-06-04
2013-06-05 15:50:27
by
yaozhq
[
专家会诊
]
[已完结]
CNT薄膜的导热率和杨氏模量计算和仿真
(0/405)
lchylinchy
2013-06-05
2013-06-05 14:41:55
by
lchylinchy
[
MS
]
[已完结]
结构粘贴时出现问题,怎样解决
(0/356)
sn6526
2013-06-05
2013-06-05 10:31:36
by
sn6526
[
Monte C
]
[已完结]
surface hopping 跃迁之后的速度调整参考文献
(0/1005)
xiaoningli
2013-06-05
2013-06-05 10:20:02
by
xiaoningli
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
Tinker6.2并行版已经安装成功,可是如何运行并行计算命令?如何设置?
(0/363)
haoguoyu
2013-06-05
2013-06-05 10:02:32
by
haoguoyu
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps里怎样获得Si-H的势
(2/452)
z654023015
2013-06-01
2013-06-05 10:01:53
by
z654023015
[
CPMD/CP
]
新手关于简单格子的晶体结构建模-gaussview & gnome crystal
(评阅+5)
(5/1906)
yoghurt117
2012-03-04
2013-06-05 04:24:31
by
一声叹息010
[
LAMMPS/
]
为什么拉伸时的应变率都这么高
(3/1881)
jinlong8937
2013-06-02
2013-06-05 00:16:59
by
hleven
[
MS
]
[已完结]
MS 4.4 linux下并行多任务时占用相同的核
(5/830)
ciwei100000
2013-06-01
2013-06-04 22:23:08
by
ciwei100000
[
MS
]
[已完结]
固体颗粒表面改性的分子模拟
(0/651)
水环境
2013-06-04
2013-06-04 20:08:02
by
水环境
[
LAMMPS/
]
[已完结]
Lammps中 设置绝热 用哪个命令
(0/372)
cumtlibt
2013-06-04
2013-06-04 18:44:22
by
cumtlibt
[
MS
]
captep 能带计算
(1/370)
dxiao1028
2011-11-12
2013-06-04 15:50:03
by
初之
[
MS
]
[已完结]
求晶体库中草酸钙晶体cif文件
(0/372)
xinye99
2013-06-04
2013-06-04 14:45:31
by
xinye99
[
专家会诊
]
[已完结]
谁知道VMD 1.9版本显示文件构型大小多少?
(4/1062)
konlin36
2013-05-30
2013-06-04 12:11:36
by
fhh2626
[
Monte C
]
[已完结]
如何比较准确地计算两个大分子的均方根位移(RMSD),如何高效地将两分子尽可能重合?
(2/2021)
asia19871122
2013-06-04
2013-06-04 12:00:38
by
pigrass
[
MS
]
[已完结]
如何画界面模型图
(3/2407)
352346571
2013-06-03
2013-06-04 10:23:10
by
pigrass
[
其他
]
[已完结]
相同长度相近横截面积的金属纳米线的热导率会高于碳管吗?
(0/298)
熊猫海棠
2013-06-04
2013-06-04 09:34:27
by
熊猫海棠
[
其他
]
[已完结]
在加溶剂效应或者气相条件下,从头算只能做0K条件下的么
(4/866)
xionger
2013-06-01
2013-06-04 09:10:56
by
xionger
[
MS
]
关于径向分布函数和配位数公式中的密度
(3/2057)
jinlong8937
2013-06-03
2013-06-04 08:48:26
by
sciencejoy
[
MS
]
[已完结]
炭材料吸附溶液中金属离子的分子动力学模拟
(1/862)
lmzhao
2013-05-27
2013-06-03 21:43:55
by
alphawei
[
LAMMPS/
]
[已完结]
pigrass领金币
(评阅-5)
(2/349)
yangwenbin99
2013-06-03
2013-06-03 20:58:06
by
pigrass
[
DS/Syby
]
[已完结]
ZDOCK 可以做包含抑制剂的蛋白质与蛋白质的对接吗
(4/1898)
keke_1210
2013-06-03
2013-06-03 17:35:03
by
keke_1210
[
CPMD/CP
]
【求助】2个cpmd问题,一个是时间步长,一个是ficitious electronic mass!
(评阅+1)
(11/1666)
yoghurt117
2010-12-04
2013-06-03 15:06:25
by
一声叹息010
[
其他
]
[已完结]
求助有MOE怎么做分子动力学?
(4/2937)
lirenshi
2013-01-30
2013-06-03 14:19:38
by
huoyongting
[
DS/Syby
]
[已完结]
sybyl中怎样还原原复合物配体药效构象
(4/989)
vivian_qi
2013-05-31
2013-06-03 11:49:12
by
win雨
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
求文献以及题目~
(8/1226)
zxl523
2013-06-03
2013-06-03 11:12:20
by
zxl523
[
MS
]
寻找北京化工大学汪文川教授和黄世萍教授的师兄师姐
(2/3004)
zs806750658
2013-06-02
2013-06-02 20:50:12
by
小春仔
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Gromacs
]
[已完结]
谁遇到过Gromacs断电后继续跑 但分析RMSD时RMSD不连续的问题啊 求大神解答
(2/1350)
gss0840401
2013-05-30
2013-06-02 08:26:12
by
gss0840401
[
LAMMPS/
]
模拟水分子吸附过程,为什么在吸附前,水分子就打散解离出氢离子
(2/1379)
futer1
2013-06-01
2013-06-02 06:43:42
by
wbn
[
资源
]
[已完结]
请教,做Quantum Molecular Dynamic计算什么软件好啊? VASP? CPMD?
(3/1173)
onlyyou2002
2013-05-23
2013-06-01 07:34:43
by
abinitio
[
MS
]
[已完结]
用MS中的Forcite计算冰,结果发现温度波动异常的大,感觉像做周期性的震荡衰减
(6/2240)
wenyu4
2012-02-05
2013-06-01 03:25:17
by
abinitio
[
专家会诊
]
[已完结]
模拟聚合物在水溶液中的构象
(7/1246)
mengsk
2013-05-21
2013-06-01 03:12:57
by
emrecoba
[
其他
]
[已完结]
请教各位前辈关于MOLGEN——QSPR的问题
(0/288)
simon_yuan
2013-05-31
2013-05-31 22:28:39
by
simon_yuan
[
Hyperch
]
[已完结]
hyperchem中模拟体系
(0/658)
janet466158
2013-05-31
2013-05-31 22:12:10
by
janet466158
[
MS
]
[已完结]
吸附量数据老是变化
(1/382)
唱歌给你听dc
2013-05-30
2013-05-31 21:49:36
by
ghcacj
[
MS
]
[已完结]
求跨尺度耦合方法的参考书
(4/708)
CelinIris
2013-02-26
2013-05-31 21:22:47
by
juwendy
[
MS
]
[已完结]
请教各位,MS能否计算出石墨烯氧化物原子的带电量?
(1/374)
jiaoyixiong
2013-05-31
2013-05-31 19:33:09
by
broken1999
[
MS
]
[已完结]
吸附后构型中没出现吸附质分子
(0/221)
唱歌给你听dc
2013-05-31
2013-05-31 19:16:17
by
唱歌给你听dc
[
Gromacs
]
[已完结]
紧急求助
(1/465)
huyingdamon
2013-05-30
2013-05-31 08:36:57
by
jiaoyixiong
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其他
]
[已完结]
关于TarFisDock 的问题
(3/1024)
simon_yuan
2013-05-28
2013-05-31 07:34:47
by
simon_yuan
[
MS
]
[已完结]
高性能平台上运行materials studio,出现提示,求助
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)
(15/2799)
synu
2012-09-03
2013-05-31 05:49:47
by
zlin610
[
MS
]
MS文件的读取问题
(4/1436)
111222000
2013-05-28
2013-05-30 22:39:34
by
111222000
[
LAMMPS/
]
晶体滑移的周期性问题
(3/724)
luomia
2013-05-29
2013-05-30 20:02:15
by
njn0516
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