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MS建 zeolite 4A模型多出很多骨架原子
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在ISCD上搜到Zeolite 4A的信息如下： Atom # OX SITE x y z SOF H ITF(B) Si 1 +4 24 k 0 0.185(1) 0.372(1) 0.5 0 1.4(6) Al 1 +3 24 k 0 0.185(1) 0.372(1) 0.5 0 1.4(6) O 1 -2 12 h 0 0.225(1) 0.5 1. 0 2.3(4) O 2 -2 12 i 0 0.290(1) 0.290(1) 1. 0 2.6(4) O 3 -2 24 m 0.114(1) 0.114(1) 0.345(1) 1. 0 2.7(3) Na 1 +1 8 g 0.200(1) 0.200(1) 0.200(1) 1. 0 0 Na 2 +1 12 i 0 0.429(3) 0.429(3) 0.25 0 0 Na 3 +1 12 j 0.204(7) 0.204(7) 0.5 0.083 0 2. Lbl Type Beta11 Beta22 Beta33 Beta12 Beta13 Beta23 Na1 Na1+ 0.007(1) 0.007(1) 0.007(1) 0.0010(5) 0.0010(5) 0.0010(5) Na2 Na1+ 0.012(6) 0.005(3) 0.005(3) 0 0 0 *end for ICSD #10288 在MS进行了以下操作： 1.build→crystal→build crystal， 设置建一个PM-3M的空间群； 2. build→atoms 加入Si原子和O原子，输入对应的wyckoff position坐标； 3. build→bonds calculate会自动把这些原子用键连起来； 4. 然后同样方法加Na； 5. 我要得到2*2*2的结构，这里显示晶胞为2*2*2。 6. 因为zeolite 4A的骨架是Si和Al各占一半，Si和Si不能同时连在一个O原子上，Al和Al也不能同时连在一个O原子上。为了替换一半的Si，我去掉了周期性，一个一个原子来改，谁有好方法进行这个步骤？ zeolite 4A的分子式是(Na)96(Al)96(S)i96(O)384 得到了晶体结构以后，我发现输出文件中有480个O；144个Si；144个Al。但是根据上面的wyckoff position分析，一个晶胞的Si和Al加起来应该是24个，2*2*2就是8个晶胞。加起来是192个，Al和Si各为96个。现在多出来48个Si、48个Al以及96个O。 我从MS自带的structure中导出LTA结构，导出文件中就是96个Si、96个Al以及384个O。但是奇怪的是，我把这两个晶胞并排仔细对照，除了Na原子外。两种情况下得到的2*2*2晶胞骨架结构没有不同，那为什么自建的晶胞输出文件中会多出来那么多原子？ 附上两个晶胞的对比图。  LTA.jpg 这是MS自带结构库中导出的LTA骨架结构  NaA.jpg 手动自建的zeolite 4A晶胞结构 [ Last edited by effia on 2013-6-17 at 17:10 ] |
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