请问如何明确一个基因是什么?
我最近在非模式生物中克隆出一个基因,想确定这个基因是什么。
但blast的结果是foxo1和foxo3,因为这两个结果的排名都很靠前,没法确定这个基因到底是foxo1还是foxo3。
于是我又都通过结构域来检索,发现与该基因具有相同结构域组成的检索结果里,同样也是既有foxo1也有foxo3。
我有点糊涂了,通过什么方法能够确定这个基因到底是foxo1还是foxo3呢,请高手指教!谢谢! 返回小木虫查看更多
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我最近在非模式生物中克隆出一个基因,想确定这个基因是什么。
但blast的结果是foxo1和foxo3,因为这两个结果的排名都很靠前,没法确定这个基因到底是foxo1还是foxo3。
于是我又都通过结构域来检索,发现与该基因具有相同结构域组成的检索结果里,同样也是既有foxo1也有foxo3。
我有点糊涂了,通过什么方法能够确定这个基因到底是foxo1还是foxo3呢,请高手指教!谢谢! 返回小木虫查看更多
1和3基因具体有啥区别没?
因为同属一个基因家族,所以很相似。
其实这个也是我想问的。我怎么才能知道这两个基因区别的官方定义呢,比如有哪几个结构域就是foxo1,有哪几个结构域就是foxo3。会有这种官方的定义吗?
序列比对其实就是电脑游戏, 参数改一改, 赏分罚分规则改一改, 排名结果就可能出现小幅度变动的。 楼主不要太纠结你克隆的基因究竟是foxo1还是foxo3, 既然和这两个都同等程度的相似, 你就先把它叫foxo-like也行。 要是你一定要弄明白到底这个基因更像谁, 你可以测试foxo1 KO 和foxo3 KO表型究竟谁能够更好地被这个foxo-like救回来。 序列比对分析给你一个方向性的指导, 但是它对不对还是需要做基因功能检验。
对的,我的意思是把基因翻译成蛋白来看,因为对于编码基因主要还是比较翻译后蛋白的差异。我现在存在的问题就是无法确定区别,KEGG是通路数据库,是不是不能用来检索单个基因?
谢谢
因为现在我要写文章,需要给一个确定的名字,最好不要是like这种。不知道您能不能给我一个如何确定的方法,最好是通过电脑软件比对分析之类的,因为我的时间很有限,来不及再去做实验验证了。谢谢
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有人知道吗?