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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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罗飞同学1993

铁虫 (小有名气)

[求助] 巢式PCR阴性对照一直有条带,且跟我目的条带大小一致,怎么解决?已有1人参与

巢式PCR:   
OUT即第一轮pcr(用F1 R2),目的条带714bp;
IN即第二轮pcr(用F1 R4),目的条带606bp;

所用引物:
Primer name Primer sequence (5’→3’)         Reference : OIE (2009)
SVCV F1  5’-TCTTGGAGCCAAATAGCTCARRTC-3’
SVCV R2  5’-AGATGGTATGGACCCCAATACATHACNCAY-3’        
SVCV R4  5’-CTGGGGTTTCCNCCTCAAAGYTGY-3’

PCR程序:95 ℃ 10 min;95 ℃ 1 min,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,35 cycles;72 ℃ 10 min

存在问题:用自来水、蒸馏水、高压灭菌后的无菌水作为模板后,P出了目的条带大小相同的条带。

排除因素:
(1) 考虑到水污染、每次都换新的无菌水;
(2)考虑到引物污染,重新合成了引物分装后进行实验(引物序列不变);
(3)考虑到MIX原因,每次实验都用新拆封的MIX(vazyme);
(4)考虑到人为操作原因,换人加样。结果,阴性对照还是出现了条带。

现在不知道怎么继续了,希望各位前辈多多指教,感激不尽!

巢式PCR阴性对照一直有条带,且跟我目的条带大小一致,怎么解决?
10.31电泳图jpg.jpg


巢式PCR阴性对照一直有条带,且跟我目的条带大小一致,怎么解决?-1
11.03电泳图jpg.jpg
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drwhoknowss

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
渊博震天: 金币+5, 鼓励回复经验交流 2018-11-11 10:44:12
罗飞同学1993: 金币+50, ★★★很有帮助 2018-11-12 09:08:18
我觉得还是污染了。知道你已经做得很辛苦了,但这种pcr污染很常见。
建议:换试验台。每步必换手套。pcr产物跟pcrset up尽可能空间隔绝。 甚至换移液枪。反正各种变态防着污染

还有,每次打开pcr tube的盖子,都用不同手指,或者换手套
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
2楼2018-11-10 22:58:50
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人生无遗憾

新虫 (初入文坛)

3楼2022-10-16 13:31:03
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人生无遗憾

新虫 (初入文坛)

个人觉得是气溶胶污染,我之前也遇到过,可以试一下将pcr管用核酸清除剂处理一下试试

发自小木虫IOS客户端
4楼2022-10-28 13:26:57
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