小木虫

当前位置：首页 > 微生物 >土壤微生物多样性分析-16S和ITS高通量测序

土壤微生物多样性分析-16S和ITS高通量测序

如题，我的课题是土壤微生物多样性，方法是用的高通量测序细菌16S和真菌ITS。

我的问题是后续分析中，PCoA图和NMDS图都会有加权和不加权的，文章中如果加权和不加权的图都放的话，怎么解释比较好，有相关的文章写得比较好的吗，可以推荐我看看。返回小木虫查看更多

今日热帖

yanlijuan

楼主是用的unifrac作的距离矩阵吗？所以有加权和不加权？随便选一个图就行。PCOA和NMDS也是差不多的unconstrained ordination…RDA是constrained ordination，考虑了处理水平的，不太一样…
lhf903

引用回帖:
3楼: Originally posted by yanlijuan at 2017-02-15 20:12:04
楼主是用的unifrac作的距离矩阵吗？所以有加权和不加权？随便选一个图就行。PCOA和NMDS也是差不多的unconstrained ordination…RDA是constrained ordination，考虑了处理水平的，不太一样…
...

加权和不加权的区别是什么，对加权和不加权的结果分别应该怎么解释~
，
lhf903

引用回帖:
5楼: Originally posted by yanlijuan at 2017-02-15 21:00:41
不加权是只考虑OTU的presence/absence（有/没有），加权会考虑它们是abundance（丰度）。
...

那你看到过文章里面加权和不加权都出现的情况吗，能够解释的很好的~
shmilying

看看回复就知道这微生物生态学都还给老师了……认真学习，要知其所以然才能解释清楚