应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 土壤微生物多样性分析-16S和ITS高通量测序
51/1返回列表
查看: 4108  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lhf903

金虫 (正式写手)

[求助] 土壤微生物多样性分析-16S和ITS高通量测序 已有1人参与

如题，我的课题是土壤微生物多样性，方法是用的高通量测序细菌16S和真菌ITS。

我的问题是后续分析中，PCoA图和NMDS图都会有加权和不加权的，文章中如果加权和不加权的图都放的话，怎么解释比较好，有相关的文章写得比较好的吗，可以推荐我看看。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2017-02-15 18:03:17
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanlijuan

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lhf903 at 2017-02-15 20:58:02
加权和不加权的区别是什么，对加权和不加权的结果分别应该怎么解释~...

不加权是只考虑OTU的presence/absence（有/没有），加权会考虑它们是abundance（丰度）。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
5楼2017-02-15 21:00:41
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

cloris222

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
小冀-: 金币+5, 鼓励回帖交流 2017-02-15 19:53:39
本帖内容被屏蔽
2楼2017-02-15 19:41:50
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanlijuan

新虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
lhf903(小冀-代发): 金币+5 2017-04-15 15:55:30
楼主是用的unifrac作的距离矩阵吗？所以有加权和不加权？随便选一个图就行。PCOA和NMDS也是差不多的unconstrained ordination…RDA是constrained ordination，考虑了处理水平的，不太一样…

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2017-02-15 20:12:04
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lhf903

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yanlijuan at 2017-02-15 20:12:04
楼主是用的unifrac作的距离矩阵吗？所以有加权和不加权？随便选一个图就行。PCOA和NMDS也是差不多的unconstrained ordination…RDA是constrained ordination，考虑了处理水平的，不太一样…
...

加权和不加权的区别是什么，对加权和不加权的结果分别应该怎么解释~
赞一下 回复此楼
4楼2017-02-15 20:58:02
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭