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一个合成的约40bp的片段怎么引入载体?

作者 jian520yi
来源: 小木虫 600 12 举报帖子
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如题,我需要在载体中加入一个纯化标签,标签两边酶切位点和载体一样,但标签是合成的小片段,40bp,怎么做?就用合成片段来扩增吗? 麻烦高手指点! 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • shaquila

    你合成的是双链,还是用两条引物退火而成
    http://edu.muchong.com/attachment/9c/48/654839_1299721150_644.jpg
    可以利用两个引物退火形成带粘端小片段,然后和载体连接

  • jian520yi

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by shaquila at 2011-08-04 19:08:59:
    你合成的是双链,还是用两条引物退火而成
    http://edu.muchong.com/attachment/9c/48/654839_1299721150_644.jpg
    可以利用两个引物退火形成带粘端小片段,然后和载体连接

    我还是有很多地方感觉不清楚,比如合成约25bpy引物,后面是用类似PCR的方法使其扩增?那酶,DNTP什么的要怎么解决?这么小怎么纯化?连接也会比较难呀。

  • shaquila

    不要扩增直接退火啊,你合成的引物浓度很高的,不用PCR扩增的

  • jian520yi

    引用回帖:
    4楼: Originally posted by shaquila at 2011-08-05 10:26:17:
    不要扩增直接退火啊,你合成的引物浓度很高的,不用PCR扩增的

    有没有这个具体方法的文献或文章,技术路线什么的?

  • 空谷幽风

    1.如果你合成的是两条单链,那么直接退火后就可以连接载体了,不过我现在很怀疑你的酶切位点处的序列设计的是否正确。如果可以把两条序列和酶切位点的名字传上来吧
    2.如果你合成的是双链DNA,请确定你的酶切位点两端的保护碱基是否够用,最后每端有3个以上,然后酶切后连载体

  • jian520yi

    引用回帖:
    6楼: Originally posted by 空谷幽风 at 2011-08-05 14:04:38:
    1.如果你合成的是两条单链,那么直接退火后就可以连接载体了,不过我现在很怀疑你的酶切位点处的序列设计的是否正确。如果可以把两条序列和酶切位点的名字传上来吧
    2.如果你合成的是双链DNA,请确定你的酶切位点 ...

    我直接不用保护碱基,就是用酶切位点直接连载体,否则酶切还要处理很麻烦!给我留个邮箱吧,好交流些!

  • shaquila

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by jian520yi at 2011-08-05 10:59:14:
    有没有这个具体方法的文献或文章,技术路线什么的?

    技术路线很简单,引物回来稀释成100pmol/ul
    两条各取2ul混匀成4ul,95度变性5min,慢退火(PCR 95度反应后直接停止关机,30分钟后拿出来放在室温)

    连接体系就是4ul小片段+载体(能达到300ng最好)+T4bufffer&ligase
    连接反应过夜~~

    做了两次,一次是平端补平加酶切位点,一次是加his-tag,都成功了,只要小片段的酶切位点别设计错了就ok~

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