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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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allpeptide

银虫 (正式写手)

[交流] 蛋白质材料:Pro-Phe-Phe自组装已有1人参与

  蛋白质材料的结构具有多功能性、生物相容性和良好机械性能,已经用于广泛的生物技术应用。通常,蛋白材料由具有β-折叠结构的自组装肽制成,和淀粉样蛋白具有共同的结构。而哺乳动物中最丰富的蛋白质--胶原蛋白是基于螺旋排列的。本文介绍最易聚集的有天然氨基酸组成的三肽,Pro-Phe-Phe,它组装成螺旋状片,由Phe的残基提供干燥疏水界面。该结构类似于功能性PSMα3淀粉样蛋白,也是淀粉样蛋白的核心结构。羟脯氨酸(胶原蛋白的主要成分)替代脯氨酸产生最小的螺旋状组件,具有增强结构的机械性能。

Pro-Phe-Phe是最易聚集的三肽

  通过分子动力学模拟分析了所有400种可能的二肽序列,证实了含有苯丙氨酸或色氨酸残基的序列具有聚集性。

  通过对20种天然氨基酸的组合排列构建的所有8,000个三肽进行计算分析并根据其聚集倾向进行排序,结果表明Pro-Phe-Phe是最易聚集的三肽。

  为了理解Pro-Phe-Phe的高阶组织,我们研究了三肽的自组装机制,研究了它的圆二色谱(CD)和红外光谱特征,

Pro-Phe-Phe的圆二色谱


  三肽组装体显示CD信号,其包含在210nm和224nm处的双负最大值,具有阳性最大值在198nm附近,具有螺旋构象的特征。这些峰值略有下降,与经典螺旋信号相比,红移显示出来在208和222nm处的负最大值,具有较低的强度。该较低的信号强度与先前的观察结果一致,即椭圆度的深度随着长度的增加而迅速减小螺旋缩短。


  傅里叶变换红外(FTIR)光谱,在1,647 cm-1处呈现出尖锐的酰胺带肩部在1,682 cm-1处,表明存在主要的螺旋构象。为了获得更多的关于Pro-Phe-Phe螺旋的分子间距的信息,研究人员使用了X射线晶体学方法。

Pro-Phe-Phe的X射线晶体学方法


  a,50%概率位移椭球中不对称单元的ORTEP图。

  b,大致沿b轴观察的头对尾氢键。

  c,沿a轴并排通过酰胺氢键堆叠。

  d,俯视图

  e, 螺旋的侧视图

  f,沿c方向的相邻螺旋状组件的芳香拉链状分子堆积。

  g,形成通过沿a方向通过分子间氢键堆叠螺旋的细长结构。 为清楚起见,肽螺旋是叠加的在e,f和g中的理想螺旋模型。 氮和氧杂原子分别以蓝色和红色显示。

  多肽在多种纳米结构中的自组装因其在生物纳米技术,再生医学和生物工程中的广泛应用而备受关注。设计功能性超分子纳米结构的短肽的方法有 试错法和模仿生物元件法。未来将会有更多类似于Pro-Phe-Phe三肽螺旋自组装的研究,而不仅限于二肽的自组装,本文提供了一个短肽自组装的新思。

蛋白质材料:Pro-Phe-Phe自组装
溶液中三肽的CD光谱,显示存在螺旋组件-专肽生物


蛋白质材料:Pro-Phe-Phe自组装-1
专肽生物


蛋白质材料:Pro-Phe-Phe自组装-2
Pro-Phe-Phe的单晶结构-专肽生物
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mkj123

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
您好,单晶怎么培养出来的?

发自小木虫Android客户端
2楼2022-07-26 01:32:59
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