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hxx593847830

新虫 (小有名气)

[求助] 真菌DNA提取问题 已有5人参与

最近在做真菌18S和ITS鉴定,使用液氮研磨、试剂盒提取DNA,已经做了一遍没有跑出条带。因为我是取了2ML菌液,自动研磨10min没有提取出来,猜想可能是提取DNA量少的原因。想问一下各位,试剂盒说是取真菌100mg,真菌菌液培养几天取样较好?取样的话取多少合适?另外,如果我用自动研磨机研磨多长时间好呢?希望有经验的大神指导!!
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renzhiq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hxx593847830: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-23 15:47:44
哈哈,你说的这个实验我比较熟悉。我做过,当初我也遇到过同样的问题。解决方法如下;
你可以将生长时间长的菌丝抽滤,用缓冲液漂洗后,在再用液氮碾磨
你也可以将生长短时间(菌体未老化)的菌液离心,用缓冲液漂洗后,再用液氮碾磨
如果这两种方法都不行就改用酶法破壁,效果会比较好。
到由于你是要做菌种鉴定,对基因组的质量要求不高,所以无论那种都可以
在样菌的过程中,切记要保证没有染杂菌
如果还有问题再联系我

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9楼2015-09-18 23:47:51
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酒家何处

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-09-15 19:12:41
量少的原因的话直接pcr就可以了 。p不出来就不是量少的问题了。可能没有裂解开。自动研磨没用过。提DNA液氮。或者普通研磨,玻璃珠等物理方法应该都差不多。

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2楼2015-09-15 13:38:42
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小可爱天

金虫 (小有名气)

为什么用菌液做?菌丝体做应该会有的。

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3楼2015-09-15 13:41:04
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小可爱天

金虫 (小有名气)


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-09-15 19:12:48
把你养的菌抽滤,用菌丝体研磨提取做。

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4楼2015-09-15 13:42:03
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199006287956

木虫 (著名写手)

真菌细胞壁比较厚,DNA不容易出来,所谓的菌落PCR,只对于一些菌能用。

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追求不惜,奋斗不息
7楼2015-09-17 22:28:35
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周宁135139

金虫 (正式写手)

我的菌是PDA培养5天抽滤得到菌体,干燥箱烘干后用组织研磨器磨成粉末,只需30毫克就足够了。

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8楼2015-09-18 23:22:09
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普通回帖

hxx593847830

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 酒家何处 at 2015-09-15 13:38:42
量少的原因的话直接pcr就可以了 。p不出来就不是量少的问题了。可能没有裂解开。自动研磨没用过。提DNA液氮。或者普通研磨,玻璃珠等物理方法应该都差不多。

谢谢

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5楼2015-09-16 12:41:23
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hxx593847830

新虫 (小有名气)

谢谢~我想到直接做菌落PCR

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6楼2015-09-16 12:41:45
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halfbeer

捐助贵宾 (小有名气)

这是啥?

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by hxx593847830 at 2015-09-16 12:41:45
谢谢~我想到直接做菌落PCR

启动时间长点,我做酵母菌体pcr启动时间15min
现在我们能做的就是努力努力再努力
10楼2015-09-24 15:46:30
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