| 查看: 2331 | 回复: 2 | |||
[求助]
如何提取植物内生真菌总DNA？
|
|
各位虫友，你们好！ 我近期想做一个实验，是通过用Roche 454 FLX+平台，用真菌ITS的通用引物对真菌ITS区进行高通量测序，分别做植物根、茎、叶内生真菌多样性的研究。但现在遇到一个问题，就是在前期处理上。主要有以下几个问题： 1.表面该如何消毒，去除表面真菌的干扰？ 2.由于是用真菌ITS通用引物，担心宿主DNA会干扰实验。在提取总DNA时，怎样才能尽可能的排除宿主DNA的干扰？而又能够尽可能多的收集到内生真菌的总DNA？ 这个实验非常的急切，所以希望虫友们，能够尽快的回复，谢谢！！！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 科研&生活。 |
» 猜你喜欢
今年审到国自然15份，谈谈感受
已经有6人回复
-
这年头没有找到涵评专家，还有中面上的可能吗
已经有16人回复
-
26/27博士推荐
已经有3人回复
-
找博士生导师
已经有4人回复
-
重磅！青年科学基金项目（C类）资助增幅预计超过50%
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 真菌DNA提取疑惑
已经有12人回复
- 内生真菌粗提物活性筛选 SCI
已经有4人回复
- 求助——真菌DNA提取
已经有11人回复
- CTAB提取液保存了一段时间，有白色漂浮物，可以用来直接提取真菌DNA吗？
已经有3人回复
- 有用过与 1.5ml离心管配套的研磨棒或者电动组织研磨器提真菌DNA的吗？
已经有9人回复
- 请教植物内生真菌筛选
已经有19人回复
- 丝状真菌提取总DNA问题
已经有14人回复
- 用真菌CTAB方法提细菌DNA可否？
已经有6人回复
- 【求助】看内生真菌的原生质体需要多少倍显微镜可见？形态如何。。
已经有4人回复
- 【求助/交流】提取真菌DNA或RNA一定要液氮研磨吗？
已经有7人回复
- 【求助/交流】急！ 帮忙分析下CTAB法提取真菌DNA的电泳图
已经有4人回复
- 【求助/交流】细菌污染对真菌提取DNA有影响么？
已经有3人回复
- 【求助/交流】氯化苄方法提取真菌DNA
已经有4人回复
- 【求助/交流】真菌提取基因组DNA的方法
已经有7人回复
kingleo99
木虫 (小有名气)
- MicEPI: 1
- 应助: 29 (小学生)
- 金币: 2102.3
- 散金: 31
- 红花: 22
- 帖子: 257
- 在线: 86.6小时
- 虫号: 530489
- 注册: 2008-03-21
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助 2012-12-12 21:53:11
江西南昌人: 金币+5, ★★★很有帮助, 这个答案应该很有用，值得尝试，谢谢！ 2012-12-13 21:09:47
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助 2012-12-12 21:53:11
江西南昌人: 金币+5, ★★★很有帮助, 这个答案应该很有用，值得尝试，谢谢！ 2012-12-13 21:09:47
| 第一个问题：一般的梯度性的升汞溶液消毒就可以将表体的真菌杀死，之后做个对照实验就可以了，比如消过毒的植物体最后用无菌水清洗一下，那个水进行培养（涂到PDA平板上）。第二个问题植物内生菌基本都是手提DNA的，提取完后的DNA采用胶纯化，而内生菌总DNA大小在10k-15k左右，而植物的总DNA很大所以这样可以将内生菌总DNA纯化出来，扩增的时候就不会受干扰！ |
2楼2012-12-12 16:48:41
3楼2012-12-13 21:08:57
20