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suyinling

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】细菌污染对真菌提取DNA有影响么? 已有3人参与

请教高手!急!!!
准备提取镰刀菌的DNA测序,但培养过程中有大量细菌污染,想知道细菌DNA对真菌DNA有影响么?
请大家帮助!
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河溪园

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
对真菌DNA的纯度和量都有影响,建议重新培养
有梦就去追!
2楼2010-11-03 10:36:53
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suyinling

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 河溪园 at 2010-11-03 10:36:53:
对真菌DNA的纯度和量都有影响,建议重新培养

测序是通过真菌的保守序列来测的,细菌的和真菌的不一样不就可以么?也不是需要很大量的真菌DNA
3楼2010-11-03 14:03:27
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):谢谢交流。 2010-11-03 20:03:49
引用回帖:
Originally posted by suyinling at 2010-11-03 14:03:27:

测序是通过真菌的保守序列来测的,细菌的和真菌的不一样不就可以么?也不是需要很大量的真菌DNA

从原理上分析好像没什么影响,但从测序反应上来讲,它需要纯度较高的DNA,如果杂质(比如掺杂的大量细菌基因组DNA)过多,会导致测序反应的背景过高,影响测序结果的准确性和可信度
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
4楼2010-11-03 14:12:54
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