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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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luwenjuanasd

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知引物序列,怎么计算扩增产物长度(bp) 已有2人参与

我已知引物序列,怎么计算扩增产物长度(bp),用blast检测过,但看不懂分析结果,也不清楚目的片段是什么,PCR新人,求各位大神指点,不胜感激!!!
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luwenjuanasd

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-01 22:33:39
看我以前发的帖子
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7739728

看了呢,就是没看懂怎么就根据比对结果知道了该对引物扩增的基因名称、物种来源、序列及产物大小,不太理解这个怎么得到的结果。。
3楼2015-07-01 22:42:14
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
2楼2015-07-01 22:33:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by luwenjuanasd at 2015-07-01 22:42:14
看了呢,就是没看懂怎么就根据比对结果知道了该对引物扩增的基因名称、物种来源、序列及产物大小,不太理解这个怎么得到的结果。。...

我觉得我说的挺清楚的,上下游引物都能和比对结果序列的相应区段匹配上,也就是说如果我们用这对引物以该物种DNA为模板,就能扩出这段序列。经blast比对,你这对引物扩增的序列应该是核糖体RNA基因,目标片段长度680bp左右。因为该基因区段序列较保守,所以匹配上了多个物种。
4楼2015-07-01 23:18:51
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luwenjuanasd

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-01 23:18:51
我觉得我说的挺清楚的,上下游引物都能和比对结果序列的相应区段匹配上,也就是说如果我们用这对引物以该物种DNA为模板,就能扩出这段序列。经blast比对,你这对引物扩增的序列应该是核糖体RNA基因,目标片段长度6 ...

这个是真菌的ITS区引物,应该扩增的是DNA吧,
5楼2015-07-02 12:39:10
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