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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 荧光定量PCR引物设计，求好心人解救小白
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wuxing707

新虫 (初入文坛)

[求助] 荧光定量PCR引物设计，求好心人解救小白 已有1人参与

转录组测序得到一条3000bp的已知序。然后要设计一对荧光定量PCR的引物，我用PP5.0在（靠5‘）端前500bp找到了一对做荧光定量的引物，检查发现引物自身没有问题，正反引物之间也没问题，可是反向引物和该条序列2000bp位置处有连续7个碱基互补配对了。那么这对引物还可以用来做荧光定量PCR吗？
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1楼 2015-06-04 19:00:22
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
错配几率很高，有可能发生错配。另外，尽量在基因的3’端设计引物。
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2楼2015-06-05 13:31:33
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