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zhang183clue

新虫 (初入文坛)

[求助] mRNA表达情况与Protein表达情况完全相反

请各位大侠帮忙看一下小弟的预实验结果吧 比较诡异

在两种不同的组织AB中检测同一种基因X,上半部分是RT的数据,明显B组织中表达量较高,且具有极显著差异;而对该X基因的蛋白进行WB检测发现其在A组织中表达量较多(内参条带一致此处并未列出数据),可以确定RT primer的特异性很好,并且购买的抗体特异性很强,无杂带。请问各位针对这种情况我应该如何解释,接下来应该如何进行研究为何他们会出现这样的差异?

万分感谢!

mRNA表达情况与Protein表达情况完全相反
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lflffeng

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问找到原因了吗?实验室有人也有这样的问题,很疑惑,求解?
2楼2015-09-02 23:16:11
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jackyoung

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

暂且假设结果没有问题,那么也就说明两个水平的调控并不一致,需要进一步分别确认:1.所检测到的mRNA水平是否真的高(完整性?引物特异不代表检测到的东西就是直接翻译蛋白的mRNA,有没有不完整片段?是否存在多种可变剪切形式等),可以用不同位置的引物,不同检测方法(如Northern杂交)确认,甚至不同的反转录方式(随机引物还是Oligo dT?);2.蛋白是否真的高(是否是真正的翻译产物?是否是有活性的形式?) 可以结合其功能对应的表型来分析,间接反映蛋白水平变化。

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CestLaVie
3楼2015-09-11 01:29:50
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jackyoung

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

其实这种情况在实验中有遇到,有多种剪切形式的问题,有检测方法的问题,此处不妄断,只提思路,希望几个月之内看到你分析的原因,愿实验顺利!(如果问题解决了,或者有帮助,希望赏金币。)

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
4楼2015-09-11 01:34:07
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