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yuyu2008

银虫 (小有名气)

[交流] 启动子活性降低但是其mRNA的表达水平却升高,这是怎么回事啊 已有3人参与

启动子活性降低但是其mRNA的水平升高,怎么回事啊
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lzh860801

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
调的启动子不够长 缺少一些元件
2楼2013-03-21 21:25:08
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普通回帖

yuyu2008

银虫 (小有名气)

您好,我先给细胞转入一个基因的启动子(长度大约为1800bp),然后用一种盐类物质处理细胞,发现其mRNA的启动活性降低,但是当我只用盐类处理细胞时其mRNA可上升4倍左右。您说的我启动子太短了,那您觉得启动活性下调这是为什么呢,至少应该没有什么变化吧,求解释,,大概一个基因的启动子多长算是比较完全一些不好意思啊,我才开始做的,很多都不懂,请指教a
3楼2013-03-22 09:38:14
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yuyu2008

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lzh860801 at 2013-03-21 21:25:08
调的启动子不够长 缺少一些元件

您好,我先给细胞转入一个基因的启动子(长度大约为1800bp),然后用一种盐类物质处理细胞,发现其mRNA的启动活性降低,但是当我只用盐类处理细胞时其mRNA可上升4倍左右。您说的我启动子太短了,那您觉得启动活性下调这是为什么呢,至少应该没有什么变化吧,求解释,,大概一个基因的启动子多长算是比较完全一些不好意思啊,我才开始做的,很多都不懂,请指教a
4楼2013-03-22 09:38:28
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yuyu2008

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lzh860801 at 2013-03-21 21:25:08
调的启动子不够长 缺少一些元件

您好,我先给细胞转入一个基因的启动子(长度大约为1800bp),然后用一种盐类物质处理细胞,发现其mRNA的启动活性降低,但是当我只用盐类处理细胞时其mRNA可上升4倍左右。您说的我启动子太短了,那您觉得启动活性下调这是为什么呢,至少应该没有什么变化吧,求解释,,大概一个基因的启动子多长算是比较完全一些不好意思啊,我才开始做的,很多都不懂,请指教a
5楼2013-03-22 09:39:58
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lzh860801

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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5楼: Originally posted by yuyu2008 at 2013-03-22 09:39:58
您好,我先给细胞转入一个基因的启动子(长度大约为1800bp),然后用一种盐类物质处理细胞,发现其mRNA的启动活性降低,但是当我只用盐类处理细胞时其mRNA可上升4倍左右。您说的我启动子太短了,那您觉得启动活性下 ...

可能是处理导致了细胞生长状况的变化,抑制住了一些生理活动,而你的启动子上可能整好缺失了响应这种处理的原件,导致了启动子活性的下降,换句话说就对于你的1800bp长的启动子 在这种处理时由于细胞生理状况的变化活性的确是降低的 但当再长一点的时候会有其他蛋白来调控它使它升高,具体启动子要多长 你得自己分析调控原件

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6楼2013-03-22 17:00:24
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yuyu2008

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
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6楼: Originally posted by lzh860801 at 2013-03-22 17:00:24
可能是处理导致了细胞生长状况的变化,抑制住了一些生理活动,而你的启动子上可能整好缺失了响应这种处理的原件,导致了启动子活性的下降,换句话说就对于你的1800bp长的启动子 在这种处理时由于细胞生理状况的变化 ...

谢谢您的分析,我再试着将启动子克隆长一些,看有什么变化
7楼2013-03-23 00:18:17
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gmrice

金虫 (正式写手)


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我师兄是做启动子的,一般基本的启动子活性七八百bp就可以,2K左右的长度是一般的启动子长度(水稻中)所以你这种现象是怎么测定启动子活性的呢?
8楼2013-03-28 15:17:40
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yuyu2008

银虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by gmrice at 2013-03-28 15:17:40
我师兄是做启动子的,一般基本的启动子活性七八百bp就可以,2K左右的长度是一般的启动子长度(水稻中)所以你这种现象是怎么测定启动子活性的呢?

我是将启动子连在载体上用荧光素酶的强弱来检测启动子的活性的
9楼2013-03-28 23:00:57
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gmrice

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
很多启动子的研究都是在载体上连接一个GUS基因,然后染色看表达量跟表达部位,但是只要你能确定确实是表达量测定的是正确的就行,你的出现的问题我觉得如果正如你所说,那恭喜你,你有了个好材料
10楼2013-03-30 08:53:38
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