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小胳膊儿

金虫 (小有名气)

[求助] mRNA与蛋白表达结果的完全相反

最近做了一个实验,mRNA用RT-PCR检测,蛋白用免疫组化检测,可是最终结果显示mRNA在癌中表达低,蛋白中表达高,这种完全相反的情况该怎么解释呢?写文章时应该怎么讨论呢?最好有相关的文献介绍一下,感激不尽!
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


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myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-23 08:53:20
真核生物的基因表达本身有多水平调控。mRNA与蛋白含量不一致的情况很常见,需要根据具体问题来分析。讨论时可以着重转录后和翻译水平的基因调控着手。文献最好是你自己查比较有针对性。
2楼2013-09-23 00:52:07
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xv1215

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-09-23 08:53:29
RT貌似只能办定量,建议做一下实时定量pcr,看一下趋势

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2013-09-23 08:05:04
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ritchiejin

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
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kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-23 09:43:49
mRNA转录过程是先于蛋白质的表达过程的,再加上后期还有对于蛋白质的修饰。所以你可以看一看mRNA的表达情况在后一个时间点上蛋白表达情况有没有什么规律。
4楼2013-09-23 09:31:12
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iayala

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-28 02:18:10
1. 查查mRNA的turn over速度,包括转录后调控等。
2. 查查有没有影响RT-PCR的因素??相对于蛋白的测定,这个结果更加令人不解,生疑。
5楼2013-09-23 11:11:00
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kk26

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-28 02:18:17
还是重复一次看看吧 会不会是材料不同?
如果确实是这样 你的下步工作会很有意思啊
坚持的保持一种热爱!
6楼2013-09-23 14:38:49
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feilinshiji

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2013-09-28 02:18:23
RTPCR定量不是很靠谱啊,建议还是用real-time做一下相对定量。一般是mRNA水平要高于蛋白水平的情况很常见,像楼主遇到的这种蛋白高于mRNA的很少见,最好重复一次,若结果相同,那就恭喜楼主了,说不定能做出一个很牛的成果
7楼2013-09-23 17:36:36
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lifuzhu3838

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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用什么做的对照呢,没有对照不能说明,mRNA和蛋白之间的表达差异吧。
活到老学到老
8楼2013-09-24 11:39:48
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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gyesang: 金币+5, 鼓励应助! 2013-09-28 02:18:33
转录本组与蛋白质组本身就不等同,转录本自身的稳定性和被翻译的效率及已经翻译后的产物的稳定性都会影响最终产物的表达量,还有翻译后加工的问题(氨基酸侧链的共价修饰、protein splicing、protein cleavage、protein folding and assemble、protein transportation and  location、N末端Met的去除等)。今天我没有时间了,愿意的话,我们改日探讨之。

建议楼主参考:
Michael B.Mathews etc edit,Transltional Control in Biology and Medicine,Cold Spring Harbor Laboratory Press,2007.
9楼2013-09-24 12:02:59
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