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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何在NCBI下载mRNA 的Ref-seq
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loop00

木虫 (小有名气)

阿凡达

[求助] 如何在NCBI下载mRNA 的Ref-seq

目的：想在NCBI下载猪全部的mRNA ref-sqe, 大概2.4万条。
我会下载猪的全部基因组，也会下载搜索到的内容。
但是当我搜索到猪的mRNA序列，点击保存的时候按照summery格式可以保存，但是按照fasta格式只下载了前500个序列，1Mb
如何才能下载全部2.4万序列呢，
谢谢
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坚强面对生活
1楼 2013-04-01 20:48:11
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
loop00: 金币+4, ★有帮助 2013-04-03 12:15:06
gyesang: 金币+1, 鼓励回帖应助！ 2013-05-31 23:09:11
一般情况下在页面上都会有一个方便的入口，下载到你想要的页面全部序列（FASTA格式）。尽管如此，大量的序列也让人眼花缭乱的了，由于下来的序列不分行，后续的编辑也很头痛。我不建议下载大批序列，因为根本用不上那么多。不知你免疫学的使用情况，全下做何用啊？
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2楼2013-04-02 06:04:12
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loop00

木虫 (小有名气)

阿凡达
引用回帖:
2楼: Originally posted by exon2002 at 2013-04-02 06:04:12
一般情况下在页面上都会有一个方便的入口，下载到你想要的页面全部序列（FASTA格式）。尽管如此，大量的序列也让人眼花缭乱的了，由于下来的序列不分行，后续的编辑也很头痛。我不建议下载大批序列，因为根本用不上 ...

我的课题是基因组学的，用的都是RNA测序技术，海量，很无奈的
必须要下载
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坚强面对生活
3楼2013-04-03 12:14:18
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loop00

木虫 (小有名气)

阿凡达
引用回帖:
2楼: Originally posted by exon2002 at 2013-04-02 06:04:12
一般情况下在页面上都会有一个方便的入口，下载到你想要的页面全部序列（FASTA格式）。尽管如此，大量的序列也让人眼花缭乱的了，由于下来的序列不分行，后续的编辑也很头痛。我不建议下载大批序列，因为根本用不上 ...

我已经从导师处找到方法，谢谢了啊
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坚强面对生活
4楼2013-04-03 12:14:41
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

找到方法了就好，祝你顺利！
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5楼2013-04-04 06:33:02
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