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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » NCBI上mRNA序列指的是那一条链
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hemabaobao

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] NCBI上mRNA序列指的是那一条链

(站内搜索一下，避免发布重复贴)
NCBI上mRNA序列指的是那一条链，为什么里面没有U呢，另外要扩全长的CDS怎么设计引物
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狼无处不在
1楼 2012-11-30 09:29:34
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liushudong63

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
虽然是mRNA，但是一般用T来替换了U，因为mRNA 是没办法测序的！你只有反转录成CDNA才能扩增测序啊！ CDNA 是没有U的 所以。。。
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冲刺人生
2楼2012-11-30 10:51:34
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你把T脑补成U呗，mRNA是对应正义链的哈。
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3楼2012-11-30 10:53:33
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ncbi的mrna序列一般都是单链cdna的反义链序列，也就是和mrn的读序一样的，但是ncbi的mrna的序列使用dna序列表示的，所以u换成了T
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4楼2012-11-30 10:55:32
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
hemabaobao: 金币+1, ★★★★★最佳答案, 懂了 非常感谢 2012-11-30 13:34:22
NCBI上mRNA序列是cDNA链的互补DNA序列，所以用T代替了U，至于要扩全长的CDS，先下载mRNA序列，找到编码蛋白的ORF，然后将引物至少设计在CDS区域的外面，即可
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2012-11-30 12:25:23
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