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hemabaobao

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] NCBI上mRNA序列指的是那一条链

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NCBI上mRNA序列指的是那一条链,为什么里面没有U呢,另外要扩全长的CDS怎么设计引物
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狼无处不在
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liushudong63

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
虽然是mRNA,但是一般用T来替换了U,因为mRNA 是没办法测序的!你只有反转录成CDNA才能扩增测序啊! CDNA 是没有U的 所以。。。
冲刺人生
2楼2012-11-30 10:51:34
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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你把T脑补成U呗,mRNA是对应正义链的哈。
3楼2012-11-30 10:53:33
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titus0805

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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ncbi的mrna序列一般都是单链cdna的反义链序列,也就是和mrn的读序一样的,但是ncbi的mrna的序列使用dna序列表示的,所以u换成了T
4楼2012-11-30 10:55:32
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖


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hemabaobao: 金币+1, ★★★★★最佳答案, 懂了 非常感谢 2012-11-30 13:34:22
NCBI上mRNA序列是cDNA链的互补DNA序列,所以用T代替了U,至于要扩全长的CDS,先下载mRNA序列,找到编码蛋白的ORF,然后将引物至少设计在CDS区域的外面,即可
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2012-11-30 12:25:23
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