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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » 酵母表达目的蛋白的mRNA半衰期
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aoaoshch

木虫 (小有名气)

[求助] 酵母表达目的蛋白的mRNA半衰期 已有2人参与

各位大侠，有没有人知道酵母表达目的蛋白的mRNA半衰期与目的蛋白的DNA序列有关系吗？

比如，在相同载体的相同位置，分别插入序列不同的2个蛋白的DNA，进行酵母表达。产生的2个mRNA，应该只有插入序列不同、其它5’3’都一样吧。这2个mRNA的半衰期是否相同呢？查了下文献，说mRNA半衰期主要和3’端相关，是否可以认为这2个mRNA半衰期基本相同？

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1楼 2014-03-19 17:44:13
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)
好像没有关系吧,我当时表达的时候没考虑过这些
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2楼2014-03-19 20:30:31
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aoaoshch

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by guoqin_shiyin at 2014-03-19 20:30:31
好像没有关系吧,我当时表达的时候没考虑过这些

是啊，很少有人讨论这个
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3楼2014-03-19 21:56:16
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aoaoshch

木虫 (小有名气)
自己顶一个吧。不知对不对：

当目的基因转录出mRNA后，由于mRNA为单链，虽然有蛋白结合以保护，但还有机会形成一些二级结构，会影响其稳定性。
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4楼2014-03-26 19:19:39
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aoaoshch: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-27 09:32:57
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-27 15:13:24
RNA的半衰期，跟你在体外提RNA时讨论的RNA稳定性没有关系。
并不是说RNA在传说中是一个"极易降解"的物质，在细胞里面就要蛋白保护着，不然就降解了。
其实RNA没有什么好不稳定的。
所谓RNA稳定性调控，指的更多的是细胞出于调控性的目的，主动的把RNA降解的过程。
是一个主动过程！
不然的话，细胞类的RNA可以稳定很长时间，比如rRNA，一些高丰都的内参基因RNA，在抑制转录之后很长一段时间都不会发现水平有所降低。
那么你这个情况是体外转入的一段序列。
原则上说，如果你是转入的一段CDS，用的又是病毒元件的强启动子和强polyA信号，这种mRNA是非常稳定的，而且因为没有剪接等过程（当然酵母里面剪接本来就很少），这类mRNA逃过了很多内源mRNA的控制系统。

mRNA的稳定性主要讨论的确实是3‘UTR，mRNA的这个区域有很多影响其稳定性的顺式元件，最著名的如Alu元件。

还是那句话，你只转CDS，这些东西大多都不存在。
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5楼2014-03-26 20:30:43
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aoaoshch

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-26 20:30:43
RNA的半衰期，跟你在体外提RNA时讨论的RNA稳定性没有关系。
并不是说RNA在传说中是一个"极易降解"的物质，在细胞里面就要蛋白保护着，不然就降解了。
其实RNA没有什么好不稳定的。
所谓RNA稳定性调控， ...

谢谢
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6楼2014-03-27 09:33:08
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deserce

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

大兄弟 参考看一下这个吧 10.1016/j.cell.2015.02.029
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7楼2020-06-23 14:14:39
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