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aoaoshch

木虫 (小有名气)

[求助] 酵母表达目的蛋白的mRNA半衰期 已有2人参与

各位大侠,有没有人知道酵母表达目的蛋白的mRNA半衰期与目的蛋白的DNA序列有关系吗?

比如,在相同载体的相同位置,分别插入序列不同的2个蛋白的DNA,进行酵母表达。产生的2个mRNA,应该只有插入序列不同、其它5’3’都一样吧。这2个mRNA的半衰期是否相同呢?查了下文献,说mRNA半衰期主要和3’端相关,是否可以认为这2个mRNA半衰期基本相同?

欢迎交流哈
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)

好像没有关系吧,我当时表达的时候没考虑过这些
2楼2014-03-19 20:30:31
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aoaoshch

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guoqin_shiyin at 2014-03-19 20:30:31
好像没有关系吧,我当时表达的时候没考虑过这些

是啊,很少有人讨论这个
3楼2014-03-19 21:56:16
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aoaoshch

木虫 (小有名气)

自己顶一个吧。不知对不对:

当目的基因转录出mRNA后,由于mRNA为单链,虽然有蛋白结合以保护,但还有机会形成一些二级结构,会影响其稳定性。
4楼2014-03-26 19:19:39
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
aoaoshch: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-27 09:32:57
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-27 15:13:24
RNA的半衰期,跟你在体外提RNA时讨论的RNA稳定性没有关系。
并不是说RNA在传说中是一个"极易降解"的物质,在细胞里面就要蛋白保护着,不然就降解了。
其实RNA没有什么好不稳定的。
所谓RNA稳定性调控,指的更多的是细胞出于调控性的目的,主动的把RNA降解的过程。
是一个主动过程!
不然的话,细胞类的RNA可以稳定很长时间,比如rRNA,一些高丰都的内参基因RNA,在抑制转录之后很长一段时间都不会发现水平有所降低。
那么你这个情况是体外转入的一段序列。
原则上说,如果你是转入的一段CDS,用的又是病毒元件的强启动子和强polyA信号,这种mRNA是非常稳定的,而且因为没有剪接等过程(当然酵母里面剪接本来就很少),这类mRNA逃过了很多内源mRNA的控制系统。

mRNA的稳定性主要讨论的确实是3‘UTR,mRNA的这个区域有很多影响其稳定性的顺式元件,最著名的如Alu元件。

还是那句话,你只转CDS,这些东西大多都不存在。
5楼2014-03-26 20:30:43
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aoaoshch

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-26 20:30:43
RNA的半衰期,跟你在体外提RNA时讨论的RNA稳定性没有关系。
并不是说RNA在传说中是一个"极易降解"的物质,在细胞里面就要蛋白保护着,不然就降解了。
其实RNA没有什么好不稳定的。
所谓RNA稳定性调控, ...

谢谢
6楼2014-03-27 09:33:08
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deserce

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

大兄弟 参考看一下这个吧 10.1016/j.cell.2015.02.029
7楼2020-06-23 14:14:39
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