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397608492

新虫 (小有名气)


[交流] 求教植物基因组及RNA提取的诀窍

如题,最近要开始做植物未知基因的克隆,以前从来木有做过,打算先利用探针在基因组上获取读码框后用cDNA逆转录。想问问对于蔷薇科植物如杏的基因组或者RNA适合用什么组织提取?因为样品要从新疆运过来,本人在上海,稍微有一点脱水的组织或者种子可以吗?有人说试剂盒不如CTAB法,是真的么?有没有做过的指导一下诀窍和注意事项或者推荐一两个好用的试剂盒,诚心求教,推销勿扰。

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晞朔

金虫 (正式写手)



397608492(金币+2): 谢谢参与
genome-DNA提取,应该没有问题。但是,RNA提取要看你样品的保存了。如果脱水很严重,很多RNA会讲解的。另外,如果你想获取的基因是组织特异性,那就得提相对应的组织的RNA。
4楼2015-04-28 13:28:23
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397608492

新虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-04-28 13:28:23
genome-DNA提取,应该没有问题。但是,RNA提取要看你样品的保存了。如果脱水很严重,很多RNA会讲解的。另外,如果你想获取的基因是组织特异性,那就得提相对应的组织的RNA。

问题是我的目的蛋白一般是种子里面表达最多,那是不是就应该用幼小的种子,还是用发芽时的幼叶,基因组的话叶子可以吗?是要幼叶还是老叶?

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-04-28 13:34:27
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晞朔

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 397608492 at 2015-04-28 13:34:27
问题是我的目的蛋白一般是种子里面表达最多,那是不是就应该用幼小的种子,还是用发芽时的幼叶,基因组的话叶子可以吗?是要幼叶还是老叶?
...

genome-DNA用什么组织都是一样的。
10楼2015-04-28 16:45:39
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lzjia_8439

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

11楼2015-04-30 09:28:05
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growlywolf

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
基因组用嫩叶提效率最高。RNA从你需要研究的组织里提,样品需要在采样现场用液氮冻存,运输用干冰,防止RNA降解

[ 发自小木虫客户端 ]
12楼2015-05-01 12:43:12
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497816705

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
未知基因克隆?你准备用什么方法做?RNA我用的是哦么噶的植物RNA提取试剂盒
13楼2015-05-02 16:25:31
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397608492

新虫 (小有名气)


引用回帖:
13楼: Originally posted by 497816705 at 2015-05-02 16:25:31
未知基因克隆?你准备用什么方法做?RNA我用的是哦么噶的植物RNA提取试剂盒

通过探针race

[ 发自小木虫客户端 ]
14楼2015-05-02 17:00:32
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KOP利

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
植物的未知物种基因组测序可以用转录组测序啊。RNA提取的话可以用液氮研磨成粉末,然后加trizol提取就可以啊
16楼2015-12-01 16:26:52
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cxkhhh

新虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
基因组RNA提取,使用试剂盒的效果是可以的,例如biog,在提取纯度上还好,能最大限度的去除杂质
17楼2018-11-06 11:26:12
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2015-04-28 13:02   回复  
397608492(金币+2): 谢谢参与
2015-04-28 13:24   回复  
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dmbb6楼
2015-04-28 14:28   回复  
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xiejf7楼
2015-04-28 14:32   回复  
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