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melaniqiuqiu

铜虫 (初入文坛)

[求助] 酵母基因组DNA中的RNA怎么去除不掉?

近日在做酵母基因组DNA的提取,提取的DNA用分光光度计检测A260/A280=1.91,琼脂糖凝胶检测小于100bp处有很亮的条带,怀疑是RNA,用终浓度100μg/ml的RNAase37℃处理2h,再跑胶仍有该条带,请教这是什么原因啊?

20121218yeastDNA.jpg
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
melaniqiuqiu: 金币+1, 有帮助 2012-12-20 15:56:18
应该不会出现这种情况,加RNAase半小时基本就能除干净。你放冰箱过夜再电泳试试。
一般即使不加RNAase,过一两天,RNA自己也会降解,因为RNAase无处不在。
Thank-you,so-blue.
2楼2012-12-20 14:30:09
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melaniqiuqiu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by susizheng at 2012-12-20 14:30:09
应该不会出现这种情况,加RNAase半小时基本就能除干净。你放冰箱过夜再电泳试试。
一般即使不加RNAase,过一两天,RNA自己也会降解,因为RNAase无处不在。

感谢回复。再请教有没有可能是RNAase失效,或者那个亮条带不是RNA?
一句承诺,一生执着
3楼2012-12-20 15:05:29
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xiangyubaoer

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼上说的RNAase无处不在,的确..不过按说去除RNA是在提DNA中的一步
4楼2012-12-20 15:23:49
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

引用回帖:
3楼: Originally posted by melaniqiuqiu at 2012-12-20 15:05:29
感谢回复。再请教有没有可能是RNAase失效,或者那个亮条带不是RNA?...

图中的最下端亮带应该是RNA无误,
RNAase失效也有这个可能。
Thank-you,so-blue.
5楼2012-12-20 15:50:57
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melaniqiuqiu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by susizheng at 2012-12-20 15:50:57
图中的最下端亮带应该是RNA无误,
RNAase失效也有这个可能。...

6楼2012-12-20 15:53:49
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mguo15

银虫 (小有名气)

你的电泳有没加RNase的对照码?RNase 很稳定,一般不会失活。如果不行,超离心可简单分离。
7楼2012-12-21 08:54:52
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melaniqiuqiu

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mguo15 at 2012-12-21 08:54:52
你的电泳有没加RNase的对照码?RNase 很稳定,一般不会失活。如果不行,超离心可简单分离。

加RNase和没加的没有什么区别~感觉RNase没发挥作用~用的是基因组提取试剂盒里自带的RNase,-20℃保存的,不知道为啥不起作用。
一句承诺,一生执着
8楼2012-12-21 13:11:06
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melaniqiuqiu

铜虫 (初入文坛)

近日把DNA原液稀释5倍后进行RNAase处理,跑胶显示RNA基本已被去除
一句承诺,一生执着
9楼2013-01-07 14:16:06
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776142

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by melaniqiuqiu at 2013-01-07 14:16:06
近日把DNA原液稀释5倍后进行RNAase处理,跑胶显示RNA基本已被去除

遇到一样的问题  哎  我的OD值都快2.1了  就是除不掉
10楼2013-06-18 14:49:46
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