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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs 怎么生成or怎么获取 含有非标准原子硼的小分子力场文件（例如苯硼酸）
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tbw258

铜虫 (初入文坛)

[求助] gromacs 怎么生成or怎么获取 含有非标准原子硼的小分子力场文件（例如苯硼酸） 已有1人参与

如题，我几乎尝试了所有的工具入 ATB PRODRG charmmaswiss ambertools acpype 都没有成功，郁闷极了
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我来了~~
1楼 2015-04-11 10:56:06
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tbw258(abinitio代发): 金币+5, 鼓励交流. 正解 2015-04-13 10:59:38
本帖内容被屏蔽
2楼2015-04-11 22:55:36
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tbw258

铜虫 (初入文坛)
acpype 可以生成框架的.itp  但是里面的关于非标准原子B的内容全为0   可以的话你就以笨硼酸为例子试试看
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我来了~~
3楼2015-04-16 10:52:25
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tbw258

铜虫 (初入文坛)
这个贴在要涔了  问题还没解决呢
赞一下 回复此楼
我来了~~
4楼2015-04-17 21:35:20
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