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玻璃花1

金虫 (小有名气)

[求助] real time PCR引物如何验证? 已有1人参与

本人在做real time PCR,之前的引物有150bp,130bp的,用常规的PCR很好验证,并且进行了realtime的实验,最近在做另外几个基因的引物验证,长度80几bp,PCR效果不好,好多杂带,目的片段看不到,请大神们帮帮忙分析分析,引物序列肯定是没问题的,想问问大家都是怎么验证引物的合理性的?实验室也没人做过这方面的,真是苦死了···跪求解答
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wrongfeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
玻璃花1: 金币+50, ★★★很有帮助 2015-04-12 22:00:13
用引物做real time PCR上机实验,
1、设置溶解曲线步骤,如果结果显示溶解曲线是单峰而且退火温度跟预测值相符,说明引物特异;如果溶解曲线多峰,引物有非特异性扩增,弃之不用。
2、将模板DNA设置稀释梯度,计算引物的扩增效率。

我一般是目的基因多设计几对引物,通过实验,选择好的用。
2楼2015-04-11 18:31:34
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