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zeroon

木虫 (正式写手)

[求助] 关于连接、转化、挑取单克隆的问题 已有3人参与

情况是这样的。以puc19为载体,在其多克隆位点插入一个片段,转化后挑取单克隆验证。在平板上挑取了将近100个单菌,才找到一个正确插入了外援片段的。有没有方法能更快更好的选择出来那些真正有插入片段的啊?
毕竟在连接的时候,多克隆位点那里会产生自连,到不是因为没有去磷酸化,因为多克隆位点双酶切后去磷酸化也没用啊,两种酶切,一个是kpn1,另一个是xho1。
上面是第一个问题。

第二个问题是,挑出了一个单克隆,放小瓶培养后,送样测序,结果返回的结果是  非单克隆现象。 也就是说,小瓶培养的菌里面有转入puc19质粒的,因为都能在amp抗性培养基里生长。现在没法子,只好继续在amp固体培养基筛选挑单菌了。问题来了,有没有更简单的方法快速挑出转化子呢?

第三个问题属于延伸类,有没有可能在转化的时候,puc19和puc19+目的片段,这两种质粒一起转入一个大肠杆菌中,这样一个菌里面,有两种质粒,那这怎么样都没法挑出单克隆来了,对不对?

问题不难,拜托各位大神了,小弟在此谢过了!
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zeroon: 金币+15, ★★★很有帮助, 谢谢 2015-04-01 23:21:10
zeroon: 金币+5, 有帮助, 看到小哥头像很帅,再加5分 2015-04-01 23:38:57
第一个问题:双酶切一般假阳性率很低的,载体双酶切后回收切开的链状载体,目的片段也是双酶切,然后连接转化,一般能在抗性平板上生长的绝大部分都是阳性克隆的,如果只是为了测序,建议使用TA克隆,要想快速筛的阳性克隆可以外加蓝白斑筛选;
第二个问题:挑菌斑的时候绝对挑取单菌落,挑取不同菌斑避免交叉污染,一般不会出现非单克隆现象的,同样的要快速挑出转化子。可以做蓝白斑筛选;
第三个问题:质粒具有排异性,一般一个细菌细胞只能转化一种质粒,类似于受精过程,一个卵细胞只接受一个精子,当然也有些专门用作转化多个质粒的工程质粒和工程菌除外。

个人见解
没有做不到,只有想不到!
2楼2015-04-01 17:57:48
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zeroon: 金币+5, 有帮助, 谢谢 2015-04-01 23:30:18
一般一个培养皿跳10个就可以了,十个没有就基本肯定没连上,去磷酸化对你这个实验是可行的,什么是去磷酸化,就是让质粒的5端失效,质粒的5失效了它就一定无法自连了。                                     2,用T载体连是最有效的,你的引物上带了酶切位点,连上后直接切就行了。     3同上。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
采菊东篱下,悠然见南山。
3楼2015-04-01 18:13:06
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tsingo

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2015-04-02 10:41:36
zeroon: 金币+1, 有帮助 2015-04-02 18:28:35
1:首先检查你的酶是否失活,如果一个酶失活,目的片段肯定连接不上。
2:转化的筛选有个比较笨的方法,就是菌落PCR,挑选单克隆为模板做PCR,这样可以在短时间内做大量的筛选。单个菌落只能挑一半,剩下的一半备用;PCR引物最好是载体上的,不然,当你的目的片段基因与你使用的克隆菌株基因同源性比较高时,假阳性比较高。
4楼2015-04-02 09:40:53
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