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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

[求助] 拟南芥T-DNA插入突变体的T-DNA序列方向问题

求教大家一个T-DNA插入拟南芥突变体的问题:
买到拟南芥的T-DNA插入突变体,在TAIR上查到插入的载体为pAC161,进入这个载体序列的链接 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AJ537514?report=GenBank),给出的信息是:载体序列长10828bp,T-DNA right border为3287..3311,T-DNA left border为 8341..8364。那么我以为3311-8364这段序列不是应该为T-DNA的插入序列吗?也就是说不是应该T-DNA的left border 的8364向右方向连接拟南芥序列吗?
但是TAIR上所显示的这个拟南芥突变体的序列信息(T-DNA部分序列连接拟南芥基因的部分序列,PCR获得的)是:T-DNA的left border 的8341向左方向连接拟南芥序列。那么这样的话,T-DNA序列应该是 pAC161中right border 3287bp向前和left border 8346bp向后的序列了? 到底是怎么回事呢?
这个pAC161载体的T-DNA序列都包括哪些单元呢?请使用过的牛人明示,谢谢!
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算了
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龚宜龙

新虫 (小有名气)

帮顶一下吧!
2楼2018-01-23 20:26:26
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