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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 拟南芥T-DNA插入突变体的T-DNA序列方向问题
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)

[求助] 拟南芥T-DNA插入突变体的T-DNA序列方向问题

求教大家一个T-DNA插入拟南芥突变体的问题：
买到拟南芥的T-DNA插入突变体，在TAIR上查到插入的载体为pAC161，进入这个载体序列的链接 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AJ537514?report=GenBank)，给出的信息是：载体序列长10828bp，T-DNA right border为3287..3311，T-DNA left border为 8341..8364。那么我以为3311-8364这段序列不是应该为T-DNA的插入序列吗？也就是说不是应该T-DNA的left border 的8364向右方向连接拟南芥序列吗？
但是TAIR上所显示的这个拟南芥突变体的序列信息（T-DNA部分序列连接拟南芥基因的部分序列，PCR获得的）是：T-DNA的left border 的8341向左方向连接拟南芥序列。那么这样的话，T-DNA序列应该是 pAC161中right border 3287bp向前和left border 8346bp向后的序列了？ 到底是怎么回事呢？
这个pAC161载体的T-DNA序列都包括哪些单元呢？请使用过的牛人明示，谢谢！
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算了
1楼 2015-03-30 17:54:31
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龚宜龙

新虫 (小有名气)
帮顶一下吧！
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2楼2018-01-23 20:26:26
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