应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 求分析一下测序结果，未得到全长
111/2返回列表12下一页
查看: 1578  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

soul光

新虫 (初入文坛)

[交流] 求分析一下测序结果，未得到全长 已有7人参与

双向测序自己拼接的结果是这样：

>fhl1cx

ATCCAAGGCCAGTTGAATTGTAATACGACTCACTATAGGGCGAATTGGGCCCGACGTCGCATGCTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATCTCGAGTCACGGAGCATTTTTTGCAGTGGAAGCAGTAGTCGTGCCAGGATTGTCCTTCATAGGCCACCACACTGGAGCCTTTACCAAACCCAGTGATGGGGTTCTTGCATCCAGCACACTTCTTGGCCACAAAGTTCTTGTAGCAATCCACGCAGTAATACTGGTCCTCCACAGCGGTGAAACGCTGCCCAGCCAGCTTCTTAGAGCAGGTAACACACACAAAGCAATCGGCATGCCAGGGCTGATCCTGGTAAGTGATTCCTCCAGATGTGATGGCCTTGTTGCACTTCACGCAATGCTTGGCAAACTTGGTCTCATGGCAAGTCACGCAGTAGAAGTCCTCCCCTTTAGGGAAGAAGCTTCCAGTCCCGATGACTTGCTTGCAGTTACTACAGGTGAAGCAGTCTTTGTGCCAGACGGTCCCCTTGTACTCCACGTTTTGATCTCCTGCCACAATGGCCTTGAAGCACCCCTTGCACTTGGGGGAGTCCTCCCGAGTGGTGCACTTGTTGCACAGGATCTTGTTGTCCTTGGCCACAAAGGTCTCATTGGCCAAGGGGTGAAGGCACTTGGCACAGCGGAAGCAGGTGTCATGCCAGAAGCGGTTCTTATAGTGCACCTCCTTGGAGTCCGCACCGATGGGCTTGCGGCATTCCACACAGGTGTTGGCACAGAACTTGTCAAAGCATTTCAGGCAGCAGTGGTGGCCATCCTTTTGCACATACTTCTTCCCCTGCAAGGGATCCCTGCAGTAGTGGCAGTCAAACTTCTCCGCCATGGTGGCGGCGGTACCCATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGCTTGAGTATTCTATAGTGTCACCTAAATAGCTTGGCGTAATACATGTTCAAAATTTAAAA

NCBI BLAST结果是这样：
（为什么我以variant1设计引物，但是P不出全长？谢谢各位！）

求分析一下测序结果，未得到全长
搜狗截图15年02月09日1306_1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-02-09 14:47:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-09 22:14:50
本帖仅楼主可见
赞一下
2楼2015-02-09 19:56:08
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

稻稻

铜虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
内容已删除
回复此楼
做一个不动声色的人，不准情绪化，不准回头看。
3楼2015-02-10 06:47:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

soul光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gegelove020 at 2015-02-09 19:56:08
是不是方向的问题，测序结果3‘和5’端的方向是不确定的，blast之后看方向唯一吗？不唯一要考虑两种情况，左端可能是3‘也可能是5’，所以分两种情况设计引物。

”blast之后看方向唯一吗“，请问如何看？
”所以分两种情况设计引物“ 是什么意思。。。不好意思，没明白，能再讲解下吗
赞一下 回复此楼
4楼2015-02-10 15:43:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

soul光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 稻稻 at 2015-02-10 06:47:44
是不是序列太长了？试试网站上的拼接

没明白。不好意思。。。能再说一遍吗
这个测序片段是双向测序的，然后自己用软件拼出来的
赞一下 回复此楼
5楼2015-02-10 16:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引物设计的时候是否注意包含全长序列了？
赞一下 回复此楼
6楼2015-02-10 20:59:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖仅楼主可见
赞一下
7楼2015-02-11 14:49:52
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

still2008

至尊木虫 (著名写手)

破碎世界的守护者
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
测序峰图有没有问题，人工核对过吗？不要一味的相信软件哦

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
有时一本正经，有时胡言乱语。
8楼2015-02-11 15:28:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冷雁孤旅

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:20:46
把你的产物拿去连接T载体或者 你告诉公司用T测序  测序的源文件自己拿来分析 你的序列不全 应该是公司在给你剪切的时候把你的部分峰图片不合格的序列给你删掉了
赞一下 回复此楼
生命不息奋斗不止
9楼2015-02-12 19:40:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ggyy0911

铁虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by soul光 at 2015-02-10 16:14:22
没明白。不好意思。。。能再说一遍吗
这个测序片段是双向测序的，然后自己用软件拼出来的...

你为什么不直接让测序公司拼好……然后看是中间缺失还是两头缺失，两头缺失的话让公司再设计引物测一段看看。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
10楼2015-02-12 21:28:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 soul光 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 17:01 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 16:45 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-01 15:08 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 15:04 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 14:55 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-01 14:50 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 10/500 2026-11-01 14:35 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 越来越担心硕士毕业后没有竞争力了 +9 zuesli 2026-10-27 15/750 2026-11-01 12:59 by Equinoxhua
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 3/150 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 6/300 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-01 12:51 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 12:38 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 4/200 2026-11-01 12:38 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 11:14 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 4/200 2026-11-01 11:01 by BCdvBAEpt3zm
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 05:22 by YXM1FDCSE8Bn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭