24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1309  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

soul光

新虫 (初入文坛)

[交流] 求分析一下测序结果,未得到全长 已有7人参与

双向测序自己拼接的结果是这样:

>fhl1cx

ATCCAAGGCCAGTTGAATTGTAATACGACTCACTATAGGGCGAATTGGGCCCGACGTCGCATGCTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATCTCGAGTCACGGAGCATTTTTTGCAGTGGAAGCAGTAGTCGTGCCAGGATTGTCCTTCATAGGCCACCACACTGGAGCCTTTACCAAACCCAGTGATGGGGTTCTTGCATCCAGCACACTTCTTGGCCACAAAGTTCTTGTAGCAATCCACGCAGTAATACTGGTCCTCCACAGCGGTGAAACGCTGCCCAGCCAGCTTCTTAGAGCAGGTAACACACACAAAGCAATCGGCATGCCAGGGCTGATCCTGGTAAGTGATTCCTCCAGATGTGATGGCCTTGTTGCACTTCACGCAATGCTTGGCAAACTTGGTCTCATGGCAAGTCACGCAGTAGAAGTCCTCCCCTTTAGGGAAGAAGCTTCCAGTCCCGATGACTTGCTTGCAGTTACTACAGGTGAAGCAGTCTTTGTGCCAGACGGTCCCCTTGTACTCCACGTTTTGATCTCCTGCCACAATGGCCTTGAAGCACCCCTTGCACTTGGGGGAGTCCTCCCGAGTGGTGCACTTGTTGCACAGGATCTTGTTGTCCTTGGCCACAAAGGTCTCATTGGCCAAGGGGTGAAGGCACTTGGCACAGCGGAAGCAGGTGTCATGCCAGAAGCGGTTCTTATAGTGCACCTCCTTGGAGTCCGCACCGATGGGCTTGCGGCATTCCACACAGGTGTTGGCACAGAACTTGTCAAAGCATTTCAGGCAGCAGTGGTGGCCATCCTTTTGCACATACTTCTTCCCCTGCAAGGGATCCCTGCAGTAGTGGCAGTCAAACTTCTCCGCCATGGTGGCGGCGGTACCCATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGCTTGAGTATTCTATAGTGTCACCTAAATAGCTTGGCGTAATACATGTTCAAAATTTAAAA

NCBI BLAST结果是这样:
(为什么我以variant1设计引物,但是P不出全长?谢谢各位!)

求分析一下测序结果,未得到全长
搜狗截图15年02月09日1306_1.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

soul光

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 稻稻 at 2015-02-10 06:47:44
是不是序列太长了?试试网站上的拼接

没明白。不好意思。。。能再说一遍吗
这个测序片段是双向测序的,然后自己用软件拼出来的
5楼2015-02-10 16:14:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

匿名

用户注销 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-09 22:14:50
本帖仅楼主可见
2楼2015-02-09 19:56:08
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

soul光

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gegelove020 at 2015-02-09 19:56:08
是不是方向的问题,测序结果3‘和5’端的方向是不确定的,blast之后看方向唯一吗?不唯一要考虑两种情况,左端可能是3‘也可能是5’,所以分两种情况设计引物。

”blast之后看方向唯一吗“,请问如何看?
”所以分两种情况设计引物“ 是什么意思。。。不好意思,没明白,能再讲解下吗
4楼2015-02-10 15:43:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引物设计的时候是否注意包含全长序列了?
6楼2015-02-10 20:59:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +12 hhhhxn.. 2026-03-23 18/900 2026-03-27 17:41 by ditto77778
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +10 幸运的酱酱 2026-03-22 12/600 2026-03-27 16:08 by muchong357
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 298调剂 +3 jiyingjie123 2026-03-27 3/150 2026-03-27 11:57 by wxiongid
[考研] 0703化学一志愿南京师范大学303求调剂 +3 zzffylgg 2026-03-24 3/150 2026-03-27 10:42 by shangxh
[考研] 求调剂 +6 林之夕 2026-03-24 6/300 2026-03-27 08:38 by hypershenger
[考研] 321求调剂 +6 Ymlll 2026-03-24 6/300 2026-03-26 20:50 by 不吃魚的貓
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 299求调剂 +4 15188958825 2026-03-25 4/200 2026-03-25 22:56 by 418490947
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +5 WW.' 2026-03-23 7/350 2026-03-24 14:50 by sprinining
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 6/300 2026-03-23 21:45 by 子系博
[考研] 一志愿东华大学化学070300,求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
信息提示
请填处理意见