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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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soul光

新虫 (初入文坛)

[交流] 求分析一下测序结果，未得到全长 已有7人参与

双向测序自己拼接的结果是这样：

>fhl1cx

ATCCAAGGCCAGTTGAATTGTAATACGACTCACTATAGGGCGAATTGGGCCCGACGTCGCATGCTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATCTCGAGTCACGGAGCATTTTTTGCAGTGGAAGCAGTAGTCGTGCCAGGATTGTCCTTCATAGGCCACCACACTGGAGCCTTTACCAAACCCAGTGATGGGGTTCTTGCATCCAGCACACTTCTTGGCCACAAAGTTCTTGTAGCAATCCACGCAGTAATACTGGTCCTCCACAGCGGTGAAACGCTGCCCAGCCAGCTTCTTAGAGCAGGTAACACACACAAAGCAATCGGCATGCCAGGGCTGATCCTGGTAAGTGATTCCTCCAGATGTGATGGCCTTGTTGCACTTCACGCAATGCTTGGCAAACTTGGTCTCATGGCAAGTCACGCAGTAGAAGTCCTCCCCTTTAGGGAAGAAGCTTCCAGTCCCGATGACTTGCTTGCAGTTACTACAGGTGAAGCAGTCTTTGTGCCAGACGGTCCCCTTGTACTCCACGTTTTGATCTCCTGCCACAATGGCCTTGAAGCACCCCTTGCACTTGGGGGAGTCCTCCCGAGTGGTGCACTTGTTGCACAGGATCTTGTTGTCCTTGGCCACAAAGGTCTCATTGGCCAAGGGGTGAAGGCACTTGGCACAGCGGAAGCAGGTGTCATGCCAGAAGCGGTTCTTATAGTGCACCTCCTTGGAGTCCGCACCGATGGGCTTGCGGCATTCCACACAGGTGTTGGCACAGAACTTGTCAAAGCATTTCAGGCAGCAGTGGTGGCCATCCTTTTGCACATACTTCTTCCCCTGCAAGGGATCCCTGCAGTAGTGGCAGTCAAACTTCTCCGCCATGGTGGCGGCGGTACCCATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGCTTGAGTATTCTATAGTGTCACCTAAATAGCTTGGCGTAATACATGTTCAAAATTTAAAA

NCBI BLAST结果是这样：
（为什么我以variant1设计引物，但是P不出全长？谢谢各位！）

求分析一下测序结果，未得到全长
搜狗截图15年02月09日1306_1.png
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1楼 2015-02-09 14:47:05
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冷雁孤旅

木虫 (著名写手)
★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-12 21:20:46
把你的产物拿去连接T载体或者 你告诉公司用T测序  测序的源文件自己拿来分析 你的序列不全 应该是公司在给你剪切的时候把你的部分峰图片不合格的序列给你删掉了
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生命不息奋斗不止
9楼2015-02-12 19:40:51
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匿名

用户注销 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-09 22:14:50
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2楼2015-02-09 19:56:08
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soul光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gegelove020 at 2015-02-09 19:56:08
是不是方向的问题，测序结果3‘和5’端的方向是不确定的，blast之后看方向唯一吗？不唯一要考虑两种情况，左端可能是3‘也可能是5’，所以分两种情况设计引物。

”blast之后看方向唯一吗“，请问如何看？
”所以分两种情况设计引物“ 是什么意思。。。不好意思，没明白，能再讲解下吗
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4楼2015-02-10 15:43:20
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soul光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 稻稻 at 2015-02-10 06:47:44
是不是序列太长了？试试网站上的拼接

没明白。不好意思。。。能再说一遍吗
这个测序片段是双向测序的，然后自己用软件拼出来的
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5楼2015-02-10 16:14:22
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